软件介绍 HiCUP是一个处理由Hi-C和捕获Hi-C(Capture Hi-C,CHi-C)产生的测序数据的流程,用于对HiC数据进行质控(QC)并得到报告。 软件的安装 ...
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软件介绍 HiCUP是一个处理由Hi-C和捕获Hi-C(Capture Hi-C,CHi-C)产生的测序数据的流程,用于对HiC数据进行质控(QC)并得到报告。 软件的安装 ...
在上一篇文章中,教大家怎么去鉴定一个基因家族,但是不是所有的基因家族都是只有一个结构域的,有些基因家族就包含很多个结构域,例如:GT family、NBS-LRR famil...
太久没有更新了,最近忙着组装好几个基因组,后面我也会吧基因组组装的一些东西分享出来哦~那就步入正题吧,我们在前面准备好了数据之后,就可以开始鉴定所需要的基因家族成员了,这样才...
1.数据准备(以CYP450为例)a.CYP450隐马尔可夫模型(hmm模型)准备Pfam数据库:http://pfam-legacy.xfam.org/[http://pf...
minimap2是我们在基因组分析过程常用的一种工具,但是它的参数很多很复杂,现在我将各项参数的内容和用法进行解析。 实例(polish 第一步)