已有的工具如circos, 只能绘制弯的染色体,又如R包chromoMap,IdeoViz,karyploteR,ggbio和在线工具Idiographica,虽然能绘制直的...
IP属地:江西
已有的工具如circos, 只能绘制弯的染色体,又如R包chromoMap,IdeoViz,karyploteR,ggbio和在线工具Idiographica,虽然能绘制直的...
有兄弟会使用cervus 进行模拟亲本分析吗?有偿
在群体遗传学中衡量群体间的遗传分化的程度的指标有许多种,较为常见的就是遗传分化指数(Fst),fst是由F统计量演变而来,F统计量主要有三种(FIS,FIF,FST)。Fst...
想问一下楼主有cervus得使用教程吗
想进一步请教一下,不知道大神方便不?
2021-09-23 cervus学习记录
哥,怎么根据LD分析进行过滤啊
SNP过滤时常用参数的解析(群体遗传)关于为何要进行SNP的过滤: 第一,低质量和无信息的SNP会影响后续群体结构或GWAS的分析结果,甚至影响后续对生物学问题的解释;第二,群体研究时,由于测序的个体较多检测出来...
vcftools是一种可以对VCF文件和BCF文件进行格式转换及过滤的工具,其中很多过滤及计算功能我们可以自己使用perl或者python编写脚本实现,但都不如这个工具的运算...