可以直接看看 ANNOVAR 或 SnpEff 或 VEP 的官方使用文档，操作并不难
RNA-seq 检测变异之 GATK 最佳实践流程tags： RNA-seq GATK STAR SNP INDEL RNA-seq 序列比对 对 RNA-seq 产出的数据进行变异检测分析，与常规重测序的主要区别就在序列比...
发简信
IP属地：广东
-
-
这里的示例需要在 linux 系统下进行操作
Bioconductor 分析芯片数据教程
这是我在 The Bioinformatics Knowledgeblog 上看到的一篇教程，原文在这里，教程条理清晰，对我理解芯片数据分析流程帮助很大，就把它翻译了过来。 ...
-
香港大学博士，手握保温杯但不资深的科研狗，开发18个R包，运营生信公众号biobabble。
-
@生信杂谈 可以的
用泊松分布解释 NGS 测序数据的 duplication 问题
tags： NGS duplication 不管从哪个角度看我们都希望测序仪产出的数据中 duplicate 率尽量低。怎样降低 duplicate 率？ 构建文库时，核酸提...
-
Single Cell RNA-seq Analysis 学习记录（一）：原理理解前言 这次学习的本体是来自剑桥大学[https://training.csx.cam.ac.uk/bioinformatics/]: Vladimir Kiselev, Ta...
-
-
de Bruijn graph组装基因组的时候，Kmer数必须是奇数的原因根本原因就是为了避免导致 正反链混淆。 如果kmer是偶数，我们会发现基因组上有些序列（如，CGCGCGCG，kmer=4）的Kmer在反向互补后得到的序列仍然是它自身！这是...
-
-
@骑驴转拉萨 应该是“或”不是“和”，抱歉，我修改一下
NGS 数据过滤之 Trimmomatic 详细说明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要，去除一些无用的序列也可以提高后续分析的准确率和效率。Trimmomatic 是...
-
分子模拟和基因组学大杂烩，我们是生物信息爱好者，开源，共享尽在生信杂谈~ 请关注微信公众号生信杂谈（xiaoddrz）获取更多原创精彩内容！<br>若您只是做基因的可以通过右侧文集筛选文章
-
利用Python进行数据分析（第二版）早鸟版介绍
暑期回家学车的时候，我为了保持自己的学习状态，于是去看《利用Python进行数据分析》。为了能够运行书上的代码，我去GitHub上下载它们随书数据，不经意间发现这本书要在今年...
-
爬取张佳玮138w+知乎关注者：数据可视化一、前言 作为简书上第一篇文章，先介绍下小背景，即为什么爬知乎第一大V张公子的138w+关注者信息？ 其实之前也写过不少小爬虫，按照网上各种教程实例去练手，“不可避免”的爬过...
-
CEL 是芯片的原始数据，txt 格式数据估计是经过处理后得到的表达量数据，你再仔细研究一下
Bioconductor 分析芯片数据教程
这是我在 The Bioinformatics Knowledgeblog 上看到的一篇教程，原文在这里，教程条理清晰，对我理解芯片数据分析流程帮助很大，就把它翻译了过来。 ...
-
最后的字写得真漂亮！
Eat-Pray-Love：饭岛爱
讲个笑话，小百合的十大是没有十个帖子的。 年后的某日，忽在Reading版看到有同级生发贴，提到当初为了找本温暖治愈的书求个内心的轻松旅行的时候，看着小清新的书名不意竟闯入女...
-
为何要在 windows 中做数据分析呢，linux 环境会方便很多，建议在Linux 中运行
Bioconductor 分析芯片数据教程
这是我在 The Bioinformatics Knowledgeblog 上看到的一篇教程，原文在这里，教程条理清晰，对我理解芯片数据分析流程帮助很大，就把它翻译了过来。 ...
-
@soooob Q20也是一个指标，可以通过FASTQC结果看数据整体质量情况。BQSR能做的只是针对碱基质量的校准，如果数据有其他的污染，当然也会影响
RNA-seq 检测变异之 GATK 最佳实践流程
tags： RNA-seq GATK STAR SNP INDEL RNA-seq 序列比对 对 RNA-seq 产出的数据进行变异检测分析，与常规重测序的主要区别就在序列比...
