记录一下分析代码 1. NGS数据准备 2. 参考基因组准备 对于模式植物，可以从多个方面补充一些注释信息，比如GO和KEGG 到这里，原始数据及基因组基本准备完毕，可以进入...
发简信
IP属地：湖北
-
转录组分析：预处理和质控 -
@荣_e687 eggNOG库里面的GO和KEGG数据很久不更新了
本地搭建植物KEGG数据库及进行注释
KEGG数据库包含丰富的功能信息及通路注释，可由此了解生物系统的功能和效用。 而官方已经不再免费提供FTP下载氨基酸以及核酸序列库，并且KAAS和Kofam等官方工具，要么在...
-
R可视化：KEGG富集分析可视化加载R包 加载数据集 KEGG富集分析 结果转换 选取前20项进行可视化 给各通路加上对应map号 ggplot2柱状图可视化 ggplot2气泡图可视化 ggplot2分类...
-
本地搭建植物KEGG数据库及进行注释KEGG数据库包含丰富的功能信息及通路注释，可由此了解生物系统的功能和效用。 而官方已经不再免费提供FTP下载氨基酸以及核酸序列库，并且KAAS和Kofam等官方工具，要么在...
-
无参物种背景基因GO注释
相似的基因在不同物种中，其功能往往是保守的。通过GO注释可获得跨物种的同源基因及其基因产物的功能描述。对于非模式生物或者无参考基因组的项目，经常需要进行背景基因的GO注释，以...
