生物芯时空

空间组学研究提供了在组织结构的空间基因信息，通过结合单细胞数据，能够描述细胞类型在肿瘤组织中空间分布的差异、细胞间的相互作用以及免疫细胞的不同分布对预后效果的影响等，为肿瘤的...

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今天小编带来一篇发表在Nature上的胶质瘤相关的文章解读。该文章利用单细胞转录组技术找到了一群独特的肿瘤细胞亚群，并利用GeoMx DSP空间转录组检测技术确认了这群特殊肿...

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感染高危型人乳头瘤病毒(HPV)导致全世界5%的癌症，包括宫颈癌和口咽癌。HPV16占大多数，并且持续的角质形成细胞感染是主要的危险因素。病毒癌基因在人类致癌中的作用已经被深...

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Y染色体缺失（LOY）与膀胱癌有关（10-40%），但其临床和生物学意义尚不清楚。本研究对自然发生的LOY突变型膀胱癌细胞以及通过CRISPR-Cas9靶向缺失Y染色体的细胞...

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接上回，在单细胞转录组 | 聚类分析中的机器学习与统计方法综述（一）[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg4MDgxMjU0Nw==&mid...

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本研究回顾性纳入18例接受双特异性抗体（bsAb）治疗的NSCLC晚期患者（aNSCLC），采用GeoMx®protein和CTA检测方案，结合特定细胞类型的圈选策略（Seg...

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即使在基因相同的癌细胞中，对治疗的抵抗也经常出现在这些细胞的一小部分中。初始群体中稀有单个细胞的分子差异使某些细胞对治疗产生耐药性；然而，人们对耐药结果的变异性知之甚少。在此...

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人类细胞图谱计划（Human Cell Atlas，HCA）旨在描述人体中每个细胞（约37万亿个）的详细特征，呈现不同类型细胞在人体组织的三维结构，勾勒他们在人体系统内的联系...

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类器官作为一种体外细胞模型，利用单细胞测序技术可以获得非常接近体内器官的基因组特征，通过结合空间转录组测序进一步得出各类细胞的空间分布特征，适用于多个领域的研究。 ● 研究思...

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单细胞转录组学测序是近几年最热门的组学技术之一，在很多高分文章中单细胞测序数据频繁出现。除去单细胞数据本身质量和数据中挖掘到的重点分子，数据的可视化展示也是一篇文章的组成核心...

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传统单细胞测序在一些方面存在挑战： 1、纵向研究或多队列研究等大型项目样本量大，在样本采集和样本运输方面面临着挑战； 2、传统单细胞测序无法对生物样本库中经过固定的存档样本进...

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Preface 随着单细胞测序技术的迅猛发展和市场的不断下沉，越来越多的研究人员都青睐于使用该技术来阐明一些生物学或医学问题，使通过传统bulk-RNA测序无法解决的事情得以...

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单细胞转录组学测序是近几年最热门的组学技术之一，在很多高分文章中单细胞测序数据频繁出现。除去单细胞数据本身质量和数据中挖掘到的重点分子，数据的可视化展示也是一篇文章的组成核心...

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蛋白质作为功能分子，在生命活动中起到非常关键的作用。但很多对于蛋白质的研究都是通过转录组间接进行的。目前基于质谱的蛋白质检测技术已经发展到4D时代，timsTOF Pro 4...

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2023年2月，复旦大学邹欣/郝洁团队在Briefings in Bioinformatics (IF=14) 以长文形式发表了题为：“scSTAR reveals hidd...

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/// 01 单细胞转录组和联合ATAC揭示肾透明细胞癌遗传调控特征 肾细胞癌是泌尿系统最常见的癌症之一，肾透明细胞癌（ccRCC）是最常见的肾细胞癌组织学类型，是具有潜在的...

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叶片中临时淀粉的正常代谢对保证作物光合作用、延缓衰老和保持高产具有重要作用。酪蛋白激酶 I1（OsCKI1）在很多重要生理过程中起着至关重要的调节作用，包括水稻的根系发育、激...

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/// 01 单核细胞测序+空间转录组测序：揭示脊髓损伤后与运动能力恢复有关的特异性神经元 本研究发现在9名慢性脊髓损伤患者的神经康复期间，硬膜外电刺激（EES）可以恢复患者...

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/// 01 汤富酬团队发布单细胞全长三代测序技术新进展 自2016年单细胞技术发展迅速，出现了大量不同原理和分离方案的单细胞技术平台，但这些平台大多数基于NGS测序，将RN...