背景 系统管理员经常需要SSH 或者telent 远程登录到Linux 服务器，经常运行一些需要很长时间才能完成的任务，比如系统备份、ftp 传输等等。通常情况下我们都是为每...
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文献阅读|新冠进化起源|Evolutionary origins of the SARS-CoV-2 sarbecovirus lineage responsible for the COVID...文献：导致 COVID-19 的 SARS-CoV-2 sarbecovirus 谱系的进化起源 发表时间：2020年7月 文章整体思路 1、无断点基因组区域的重组分析与鉴定...
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Caret Package – A Practical Guide to Machine Learning in R
利用caret包的createDataPartition()函数将数据集分为一定比例的训练集和验证集 Create the training and test dataset...
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GEO与SRA数据库|编号的对应与数据批量下载一、GEO Datasets各种编号的意义 首先需要捋清楚GEO Datasets中的各种编号。 GPL，platform ID。记录测序或芯片的平台，对于芯片平台，其包含基...
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GEO DataSets数据集的高级检索与批量筛选根据所需构建的数据库内容，运用NCBI的高级检索功能，在GEO datasets中进行数据集的检索。此处可以对检索范围进行详细的框定，方便后续的文献筛选，提高效率。 得到初步...
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单细胞测序文献阅读及补充Single-cell RNA sequencing: Technical advancements and biological applications[1] Abstr...
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Linux服务器配置R
让我们使用conda search r-base在conda的频道中检索： ... r-base 3.5.1 hfb2a302_1009 anaconda/cloud/con...
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文献阅读 | RBPs | Analysis of RNA-protein networks with RNP-MaP defines functional hubs on RNA文献：通过RNP-MaP确定RNA与蛋白质作用的核心功能区域的方法来分析RNA-蛋白质互作网络 发表时间：2021年3月 BACKGROUND 作者 生物化学实验室，研究领域...
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干货 | 全基因组CRISPR文库筛选数据分析——MAGeCKFlute近年来，全基因组CRISPR文库筛选技术被广泛应用于肿瘤及病毒相关调控因子筛选。通过同时sgRNA文库同时敲除全基因组的不同基因，经流式或药物筛选目的细胞表型，并扩增sgRN...
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CROP-seq文献学习（CRISPR液滴测序）最近听了一个讲座，里面提到了一些对于我来说比较陌生的技术：CROP-seq、CRISP-seq、Perturb-seq。（虽然这些技术早在2017年就发表了）于是就查阅了文献...