Hayley笔记

单细胞绘图系列： Seurat绘图函数总结[https://www.jianshu.com/p/95e61f7e834d] 使用ggplot2优化Seurat绘图[https...

木舟笔记

[TOC] 简介 大多数期刊文章的第一个表，即Table 1，是根据暴露程度分层的研究人群基线特征的描述性统计表。table1 包使得使用R生成这样一个表非常简单。结果输出格...

尐尐呅

为了充分利用组学技术的进步，更全面地了解人类疾病，需要新的计算方法对多种类型的组学数据进行综合分析。2021年6月《Nature Communications》发表了一个有监...

五谷吃不完了

I. Network analysis of liver expression data from female mice: finding modules related ...

纪伟讲测序

对于基因的差异表达谱，常用热图作为展示。但有时差异基因可能非常的多，热图中不可能将所有基因的名称标注出来。那么此时不妨选择一些比较重要的基因（比方说p值最显著的那些），在图中...

felixhell

在医学杂志中，几乎绝大多数的生存曲线比较，都是用log-rank检验。根据我个人的审稿以及看到的文章情况，怎么也在98%以上。然而，log-rank检验并非生存曲线比较的万能...

凯凯何_Boy

TCseq包提供了一个统一的套件去处理不同时序类型的数据分析，可以应用于转录组或者像ATAC-seq，Chip-seq的表观基因组时序型数据分析。该包主要的集中于不同时间点的...

Seurat_Satija

导读 在肿瘤相关研究中，一张精美的生存分析图，已经成了肿瘤研究高分文章的标配。好的临床预后效果，往往在一定程度上决定了文章发表的层次。然而对刚刚拿到一个新基因的新手来说，生存...