转自iProteome，略有修改，作者：项杭，翻译自2018年 CELL文章The Human Transcription Factors， 授权转载。ScienceDire...
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《自私的基因》 读书笔记创造人工智能的人类又是一个怎样的存在呢？人类又是如何在时间的长河中塑造为今天的模样的呢？ 英国皇家学会会士理查德·道金斯的《自私的基因》将提出一个极具争议的话题：人生来自私，...
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基因编辑如何换药不换汤
To destroy is easier than to create，摧毁总比创造要简单，这句话转换到基因编辑上就是：knockout比knock in容易。因为knock...
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Cre-LoxP条件性基因编辑系统--学习笔记背景 Cre/LoxP系统来源于F1噬菌体，是非常经典有效的基因编辑技术。 1. 什么是Cre Cre重组酶(cyclizationrecombination)，它是一种由3...
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第七章 拉马克和他的获得性遗传
达尔文主义者的眼里，基因的变化是随机性的，人后天的行为不会通过基因传递给后代。这就是说，人的后天努力和改变没有生物学上的意义。 然而，另一种进化学说认为生物后天的...
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GTF/GFF文件的差异及其相互转换我们在做生物分析的时候，经常会碰到GFF格式的文件以及GTF格式的注释文件。他们有着相似的名字，甚至连内容都极为相似~那么，他们究竟差在哪里呢？ GFF全称为general ...
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转变Genotype数据格式（Hapmap，Plink ，VCF ，Haplotype， Numeric ， BLUPF90 格式的相互转化）主要使用blupADC[https://qsmei.netlify.app/zh/post/2021-04-21-r-package-rblupadc-overview/ov...
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bed文件转成等bin的bedgraph格式目的： 当你想可视化你所研究的数据在染色体上分布，可能会用到RIdeogram来画类似的图。如何整理成要求的输入文件格式呢？ 标准输入文件： 一定长度为bins 的count...
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远程控制及投屏工具（PC/android）笔记本远程控制工具 向日葵个人免费版(300kb/s)image.png Todesk(目前内测中，没有网速限制) 推荐image.png Teamviewer(易检测商用)...
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GATK下游VCF maf可视化
VCF可以通过不同的上游分析获得，在格式上又有一些不同，盲目转化会带来很多问题。查看VCF文件内容可知是通过GATK上游处理得到的。 为了对变异结果进一步进行可视化分析，查找...
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BLAST结果可视化老板就是上帝 上帝说要有光，于是就有了光 导师说要有可视化结果，于是我努力把结果可视化~ 前情提示 为了知道测序reads中污染物的来源，我们之前学习使用了blast，甚至为...
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2020-06-29 GTAK4 从小白到跑通一个best practice pipeline—— 从一无所知到前期工作准备妥当的整个学习路径，涉及到多篇文档，算是一篇流水账(在gatk4网站的文档海洋中漫游真的会被呛死...) 前言：最开始当然是想越快跑起来越好，跳...
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2020-01-13 序列比对（一）：入门序列比对定义 序列比对（特别是pairwise alignment）是指以某种方式排列两个序列，对齐具有相似性的区域。 例如GATTACA和GATCA的对齐（注意这两个序列长...
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【Windows】 Dos编程入门背景: 目前windows电脑很少有人学习dos 语法了，一般可以下载一个git 工具，这样可以使用linux命令操作本地文件了； 如下图： 日常我们大都使用Windows ...
