分享一些简单的指令，以及conda的安装。 whoami 可以查看当前使用账号 / 表示根目录 以根目录为开始位置编写的路径叫做绝对路径 ...
发简信
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绘制差异基因kegg注释图
“差异基因kegg注释图”是转录组分析结果的重要组成部分，能够帮助大家了解差异基因分属于哪些代谢通路，文章中如果能够插入下面这类图来说明样品间的差异，一定会为你的文章增色不少...
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生信小白——初学 samtools上文提到用bowtie2获得了三个sam文件，但通常会将其转化为bam文件进行查阅。 使用conda下载samtools工具，过程参考《生信小白——初学bowtie2》。 s...
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生信小白——初学 bowtie2
本文就以生信小白的角度，简述bowtie2的下载、安装及使用。关于bowtie2的使用教程非常丰富，具体的概念本文不再赘述，只对操作过程进行简(xi)简(zhi)单(ru)单...
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@hsy_hzauer 非常感谢你的回复！我现在掌握一些简单地指令。因为我在解决实际问题上还有些困难，稍后我会把我的问题具体写在文章里，麻烦你能解答一下吗？
mRNA-seq学习（二）：Bowtie2比对
1. 比对之前需要考虑哪些问题 1. 选什么作为参考序列 基因组序列既能做表达定量，还能发现新的基因和转录本 转录本序列（CDS / cDNA / 基因集）表达定量 2 gf...
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你好，我是一名生信初学者，有几个问题想请教~我是Mac连接服务器终端环境下操作的，建索引是在我bowtie2程序目录下进行还是在我的根目录下进行？参考基因组我已经上传至服务器，需要放在程序目录下嘛？如果放在其他目录下应该怎么输入？还望不吝赐教~谢谢
mRNA-seq学习（二）：Bowtie2比对
1. 比对之前需要考虑哪些问题 1. 选什么作为参考序列 基因组序列既能做表达定量，还能发现新的基因和转录本 转录本序列（CDS / cDNA / 基因集）表达定量 2 gf...
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如果你是程序员，或者有一颗喜欢写程序的心，喜欢分享技术干货、项目经验、程序员日常囧事等等，欢迎投稿《程序员》专题。 专题主编：小彤花园 http://www.jianshu.com/users/4a4eb4feee62/ 【程序员】专题拒稿指北：http://www.jianshu.com/p/7c8b33b5f63b 投稿须知： 1.收录相关技术文章，但不限于技术，也可以是项目经验类的文章和程序员日常。 2.文章內不得有任何推广信息。包括但不限于公众号、微博、微信，更不得在通过投稿后再修改文章加入推广信息。你可以将这些推广以及个人信息放在个人主页介绍里。 3.字数极少，段落混乱，大段代码没有放到代码框的文章不收录 4.不相关的内容不收录，请确认文章内容和本专题相关 目前针对优质作者及爱好者，开设了官方程序员微信群，希望加入请发简信给主编小彤花园索取个人微信，主编会将你加入到【程序员】微信群，分享内容，收获知识。添加微信时备注昵称。
