原文：信号通路研究思路_百度文库 https://wenku.baidu.com/view/449d5a41ec3a87c24128c450 证明一个药物能通过抑制P38表...
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单细胞文献12- 持续感染 SARS-CoV-2 的 COVID-19 患者的临床和分子特征Clinical and molecular characteristics of COVID-19 patients with persistent SARS-CoV-2 ...
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文献学习008--[sc]两篇PBMC单细胞文献阅读1. A single-cell map for the transcriptomic signatures of peripheral blood mononuclear ...
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基于R语言绘制坐标轴截断图画图时经常遇到不同组的数据大小相差很大，大数据就会掩盖小数据的变化规律，这时候可以对Y轴进行截断，从而可以在不同层面（大数据和小数据层面）全面反映数据变化情况，如下图所示。 ...
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R小tip(五）截断坐标轴画法前言 转载自：https://www.jianshu.com/p/de283990ecd1[https://www.jianshu.com/p/de283990ecd1]以获...
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limma的两个弟弟：edgeR和DESeq201—研究背景 上一篇公众号我们为大家详细的介绍了R软件包limma筛选差异基因，limma包做差异分析要求数据满足正态分布或近似正态分布，如基因芯片、TPM格式的高通量测序...
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pheatmap热图技巧合集突然间发现，我一做热图就用pheatmap几乎不存在第二个选项了。是时候跑一遍pheatmap的demo了. Examples scale是一个值得注意的参数，它旨在说明你想...
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TCGA转录组差异分析后多种基因功能富集分析：从GO/KEGG到GSEA和GSVA/ssGSEA（含基因ID转换）测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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简单小需求：如何将FPKM转换成TPM？
刘小泽写于19.2.21或许这还是个比较常用的需求 我们做转录组分析，得到的结果可能是FPKM。但是FPKM确实存在不准确性，推荐使用TPM。 read count和FPKM...
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批次效应及多数据集合并
如何判断有批次效应 数据集中明确说明 Boxplot图 聚类树 PCA分析 芯片数据的处理 1.批次效应不能被消除，只有尽可能的降低。2.是否会矫枉过正？① 联合分析正常组为...
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循环函数的基本类型for 和 while
1. for循环 for (var in seq) expr var表示循环变量seq为向量，限定了循环变量的取值范围和循环次数expr为执行的语句（按照seq的顺序依次执行...
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个人向ggplot2箱线图总结主要从如何看图、用图与作图三个方面来对箱线图进行理解和总结。 1、看图 如图所示，箱线图是将一组数据按照大小顺序排列后进行绘制的，包含6个数据节点，分别表示出数据的上边缘、上...
