花事Le

第一步Graph-short运行结束，原文中说“需要在bandage中评估，识别线粒体缘来缘的序列。需要通过mapping 到NCBI数据库中mt和cp的CDS序列，而低于mt-like contig平均深度的10%则认为是核来源的reads。“”请问作者这些步骤怎么操作 ? 我这里第一步生成的og.filterd.gfa好大，有63Mb..

跟着Briefings in Bioinformatics学数据分析：植物线粒体基因组组装流程GSAT初步尝试

论文 Master graph: an essential integrated assembly model for the plant mitogenome based ...

小明的数据分析笔记本

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来源：http://ddrv.cn/a/185068 代码 bowtie2 -x../reference/lambda_virus -1reads_1.fq -2reads_...

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1、提取文件中第1列数据 awk '{print $1}' filename > out.txt 2、提取前2列的文件 awk `{print $1,$2}'filename...