TPM是RNAseq测序结果里很好的归一化表达矩阵,以前都是FPKM,但目前TPM才是主流,很多测序公司也开始用TPM作为基因定量单位进行分析了,基因表达分布、相关性系数和主...
TPM是RNAseq测序结果里很好的归一化表达矩阵,以前都是FPKM,但目前TPM才是主流,很多测序公司也开始用TPM作为基因定量单位进行分析了,基因表达分布、相关性系数和主...
首先这个名字要写对:ChIP-seq,有很多论文没注意大小写,其实没理解每个字母所代表的含义。ChIP-seq大致原理看一看: Figure 1: Workflow of a...
ChIP(Chromatin immunoprecitation)是研究体内DNA与蛋白质相互作用的重要工具。 “染色质”就是由“组蛋白和DNA”组成的物质;“免疫”就是通过...
1.参考文献 Brookes, E. et al. Polycomb associates genome-wide with a specific RNA polymeras...
第五节:基因差异表达分析 在本节教程中,我们将介绍基因差异表达分析的相关知识。在单细胞数据分析中,差异表达分析可以具有多种功能,例如鉴定细胞群的标记基因,以及跨条件(健康与对...
在拿到单细胞测序数据后,非常关键的一步是做细胞类型鉴定,如果这一步不准确,那么后续所有分析都将不可靠。这需要有比较准确而合适的marker基因列表,然而大部分情况下marke...