参考生信技能树1以及生信技能树2只记录从数据下载，到最终结果展示，具体生物学知识请自行查阅稍后关于ChIP-seq的背景知识我会再发布一篇文章。数据下载：数据存放地址关于环境...
发简信
IP属地：北京
-
ChIP-seq详细分析流程 -
从官网上下载TCGA数据不知从TCGA下了多少次数据了，每次都像失忆了一样重新研究……果然凡事都该动笔记下来 TAT本次以肝癌数据为例操作系统：MAC OS 1. 登陆TCGA网站 https://...
-
用R将fasta文件转换成CSV文件格式
mikesqc2021年1月14日 工作中有时需要对“核酸序列”文件进行各种格式的转换。最近由于工作需要，需将fasta文件转换成CSV文件格式。做为一名R语言初学菜鸟，首选...
-
转录组分析——STAR+RSEM+Deseq2STAR+RSEM+Deseq2视频课程链接已经公开, https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?p=8[https://www...
-
R语言学习准备工作-R包安装练习
参考http://www.bio-info-trainee.com/3727.html 第一个准备工作是安装必备软件，参考视频链接：https://share.weiyun....
-
-
2021-2-3-利用anaconda+prefetch+aspera从NCBI的SRA数据库中下载原始测序数据记录下下载过程，为自己和后人避坑。 1.Conda连接不上镜像源问题 首先是anaconda安装软件或创建环境时遇到的问题。即使换完清华源和其他镜像源以后依旧报错。 尝试了很...
-
RNA-seq用hisat2、stringtie、DESeq2分析一、安装软件 1、HISAT2 将reads比对到基因组上 2、StringTie 将比对好的reads进行拼装并预计表达水平 3、SAM tools 课上已经用sudo a...
-
GATK4流程学习之DNA-Seq variant calling(Germline：SNP+INDEL)GATK4流程学习之背景知识与前期准备 - 简书[https://www.jianshu.com/p/97e803755fa6]GATK4流程学习之DNA-Seq varia...
