细胞注释是单细胞分析中很关键的环节，初期会比较痛苦，做多了才会悟出一些规律。 我公众号早期写过几篇细胞注释相关的帖子： 单细胞分析实录(7): 差异表达分析/细胞类型注释 S...
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推荐几个细胞注释网站 -
【单细胞转录组】人类B细胞亚群分析Marker基因汇总由于基因表达跟细胞表面蛋白的表达具有时间差，所以要根据经验具体情况具体分析，内容仅供参考 哺乳类动物B细胞的分化过程主要可分为前B细胞、不成熟B细胞、 成熟B细胞、活化B...
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GSEA学习笔记春节后的第一次写学习笔记，还是要提醒大家没事别聚集、别聚集、别聚集！重要的事情说三遍！ 前几天看到公众号里写了GSEA的文章，虽然我之前跟着很多网上的教程走过一遍GSEA分析...
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暂别简书，后会有期
我不是老师，也不是大神，更不是前辈。我只是个普通的科研工作者，一个只想努力变得更好的人。 来到简书快3年了，期间写了不少的笔记。很多的笔记是在疫情严重时wfh的时候写的。至今...
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一文解决单细胞亚群注释的所有问题
好久没更新了，上来小编得写一个有分量的推文暖暖场。其实细想一下，不能全归因于平时太忙（还是太懒了），因为最近看到其它很多小伙伴做的很好且都在不断更新。其实抽出时间写一写推文对...
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免疫细胞注释-3：B细胞scRNAseq免疫细胞注释： 免疫细胞注释-1：T细胞[https://www.jianshu.com/p/0127c9b380c9] 免疫细胞注释-2：髓系细胞[http...
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R四大高效编程神器——apply家族
本节提要：apply()函数sapply()函数lapply()函数tapply()函数 熟悉R编程的人都知道R语言的apply家族，而R语言入门容易，简单学一学就能写出一些...
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RNA-seq的counts值，RPM, RPKM, FPKM, TPM 的异同
RNA-seq的counts值，RPM, RPKM, FPKM, TPM 的异同 现在常用的基因定量方法包括：RPM, RPKM, FPKM, TPM。这些表达量的主要区别是...
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