在实践之前，我先查找了一下有关组蛋白修饰的知识点：（参考文章：https://www.jianshu.com/p/8aca72809c5c） 组蛋白修饰能预测染色质的类型（异...
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ChIP-seq实践(H3K27Ac,enhancer的筛选和enhancer相关基因的GO分析) -
基因表达趋势分析-2：Mfuzz基因表达趋势分析-1：TCseq[https://www.jianshu.com/p/b808085c7351] Mfuzz能够识别表达谱的潜在时间序列模式，并将相似模式的基...
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limma 差异分析透彻讲解基因表达差异分析是我们做转录组最关键根本的一步，edgeR+limma是目前最为推荐的方式。本文结合示例数据，将对这个过程进行梳理，让你明白limma包的why，what，h...
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featureCounts统计counts后的cpm和tpm计算
该脚本适用于featureCounts数counts后的cpm和tpm计算 setwd("~/Desktop")#设置工作目录 countdata<-read.table("...
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200904 Circ之旅4.1-Circexplorer2
Circexplorer2 参考文档： CIRCexplorer2手册 tophat的安装与使用 这个主要记录一下使用Circexplorer2的流程 目前已经通过之前的步骤...
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会了GEO数据下载，来看看怎么上传吧刘小泽写于2020.8.12 1 注册NCBI GEO账号 先注册NCBI账号，在：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 然后注册GEO账号，在：htt...
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ATAC-Seq 数据分析（上）背景： 染色质和染色体的结构和功能 每一条染色单体由单个线性DNA分子组成。细胞核中的DNA是经过高度有序的包装，否则就是一团乱麻，不利于DNA复制和表达调控。这种有序的状态...
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第9篇：差异peaks分析——DiffBind学习目标 学习用DiffBind流程评估两个样本间的差异结合区域 用PCA评估样本间的关系 评估不同工具得到的差异peaks的一致性 评估差异peaks富集的工具 ATAC-...
