生态数据

宽数据 宽数据是指数据集对所有的变量进行了明确的细分，各变量的值不存在重复循环的情况也无法归类。数据总体的表现为 变量多而观察值少。每一列为一个变量，每一行为变量所对应的值。...

R语言数据分析指南

安装所需要的R包 加载所需的R包，并将默认主题设置为theme_bw()，并将图例放在图的顶部 创建一些基本图像： patchwork包水平拼接 垂直布局可以通过向plot_...

Oodelay

加载并查看数据基本情况 一、处理缺失值 查看NA的分布情况，有一个直观了解 根据NA的分布情况，获取数据子集 1. 删除法 当缺失值占比不大时，直接删除缺失部分是最简单的办法...

GPZ_Lab

在微生物组研究中，alpha diversity即“分析在单个样本中有多少种不同的序列”；beta diversity即“分析在一定范围内样本中，各种不同序列的分布情况”。描...

超人立志做国王

首先利用qiime diversity alpha-rarefaction命令进行Alpha多样性指数稀释曲线分析，具体用法参考qiime2官方文档。 结果如下图所示： 上面...

GPZ_Lab

本次笔记内容：qiime2-2019.1的16s分析流程，以没有barcode，以demultiplexed的fastq文件为input.同微生物组16S rRNA数据分析小...