一、定义二、indel的左对齐三、多等位位点的左对齐 定义 在二代测序中，使用bcftools call或者 gatk HaplotypeCaller工具检出变异位点的时候，...
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变异位点的归一化(normalization of indel)
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测序数据的深度、覆盖度等计算Coverage Depth 覆盖深度 mapping depth 基因组被测序片段（短读 short reads）“覆盖”的强度有多大？ 每一碱基的覆盖率是基因组碱基被测序...
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随笔 | 2020 #1
在2020的第一个月月中才想起在简书上写点什么... 立个Flag，6月前分享10篇文章。 由于学习的需要，对于linux、算法原理、统计学方法及原理需要接触的越来越多，以后...
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从GitHub安装R包报错Error: Failed to install 'Rpackage' from GitHub: Does not appear to be an R packa...
从GitHub安装R包报错Error: Failed to install 'Rpackage' from GitHub: Does not appear to be a...
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Maaslin2安装使用
又是Curtis Huttenhower实验室开发的软件~ MaAsLin2是全面的R软件包，用于有效确定临床data和微生物组学特征之间的多变量关联。 MaAsLin2依靠...
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Tajima's D 中性检测的指标
Tajima's D - Wikipedia[https://en.wikipedia.org/wiki/Tajima%27s_D] Tajima's D是由日本研究员田田文...
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答生信从业人员的N个问题（更新非常慢）问题链接：http://www.jianshu.com/p/88611ef94bd7 Ubuntu 相关 chmod的用途，场景 chmod即change mode, 是用于...
