前言 今天说一下如何“上位”~ 1.大神橙子牛奶糖已经写得很清楚了,不多写: https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/13813946.ht...
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RepeatMasker是重复序列检测的常用工具,通过与参考数据库的相似性比对来准确识别或屏蔽基因组中的重复序列,属于同源预测注释的方式。下文除了RepeatMasker的使...
gbff是NCBI基因组数据库常见的基因组genebank格式文件,在实际分析中,常常需要gff格式或者gtf格式,所以就存在gbff转换gff格式的需求image.png ...
请问第四步里的spinach_pep_v1.fa是什么文件
您好,请问若所测物种有很多亚型,NCBI中有20多个亚型全基因组参考序列,而自己也不清楚测序的物种属于哪个亚型,这种情况在从头预测时要选择哪个亚型的基因组作为参考基因组
基因功能注释方法基因组注释(Genome annotation) 是利用生物信息学方法和工具,对基因组所有基因的生物学功能进行高通量注释,是当前功能基因组学研究的一个热点。de novo组装...
写在前面:在上亿年的进化历程中,基因组经历了大大小小的改变。从小的核苷酸突变、插入、缺失到大的基因缺失、重复、基因组重排和水平基因转移。基因组比对可以通过比对序列中的同源区域...