tpm3 <- function(counts,len) { x <- counts/len return(t(t(x)*1e6/colSums(x)))}
发简信
IP属地：安徽
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Raw data 计算TPM
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假基因假基因也叫伪基因，他是基因家族在进化过程中形成的无功能的残留物。它与正常基因相似，但丧失正常功能的DNA序列，往往存在于真核生物的多基因家族中，常用ψ表示。 假基因可视为基因...
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Galaxy 本地搭建一最近要做转录组数据分析的pipeline，很是头疼，想了很多也不太清楚到底要怎么做，最近听说有个galaxy可以搭建生信分析平台，就来学习一下 ~~~~（真真是学海无涯啊。。...
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Single-channel基因芯片笔记
数据：single channel的RMA data 数据来源：ArrayExpression RMA数据处理 A<- read.csv(file="datExpr0.csv...
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STEP6:WGCNA相关性分析因为样本数量比较可观，所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析，挑选的标准可以是top变异程度大的基因集合，或者显著差异表达的基因集合等等。...
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推荐一些比较好的生信论坛
国外的论坛：biostars：https://www.biostars.org/里面有许多平时操作时遇到的生信问题的解答，非常实用SEQanswers：http://seqa...
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生信宝典文章集锦
程序学习心得 生物信息之程序学习 如何优雅的提问 Linux 学习 Linux学习-文件和目录 Linux学习-文件操作 Linux文件内容操作 Linux学习-环境变量和可...
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生信媛公众号文章目录
这资源实在太赞，情不自禁想要分享与大家一同学习。我是一个不喜欢用手机看公众号文章的人，但与每一个生信入门者一样急切的需要干货资源得以入门进阶，这就是一个学习的宝库。说句实话，...
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