在单细胞数据分析中，在确定细胞类型后，除了可以进行差异表达基因分析外，还可以针对单个细胞类型进行分析特定分析，这时就需要我们提取细胞子集分开处理了。 一、Seurat数据格式...
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Seurat取子集时会用到的函数和方法 -
Anaconda下安装scanpy虽然anaconda包含了很多python库，但并没有scanpy。于是我简单地学习了如何使用pip、conda这些命令安装第三方包。 先说我安装成功的方法。 1.下载sca...
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【哈佛大学：计算生物学 & 生物信息学】学习记录（二）笔记主要内容：1~3代测序技术，fastq文件 & FASTQC （1）测序技术 1、一代测序技术：Sanger Sequencing 测序条件：需要有足够的量的单链DNA，...
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cytoscape及APP(插件)使用手册
写在前面： 对于我们大多数来说，用图形或图表更比数据本身更能说明问题，更容易让人理解，并且可以赏心悦目。细胞内部，大量的分子时刻都在发生着变化或相互作用。对于我们来说，了解这...
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机器学习中分类器常见评价指标
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ProDy学习笔记（三）—— GNM和ANM原理GNM和ANM的渊源 弹性网络模型 (elastic network model, ENM)将蛋白质的每个残基简化为一个Node, 用其Cα来代替, 残基之间的相互作用简化为...
