写在前面 由于我们实验室的主要研究对象是荔枝，而在ncbi上的blast中还没收录荔枝基因组信息，所以使用起来不是那么方便。那么我们能不能实现一个本地的blast网站，使我们...
发简信
IP属地：吉林
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用viroblast搭建本地blast网站 -
有没有什么包，对标准化后的数据，比如fpkm进行差异分析？
转录组入门（7）：差异表达分析
这个步骤推荐在R里面做，载入表达矩阵，然后设置好分组信息，统一用DEseq2进行差异分析，当然也可以走走edgeR或者limma的voom流程。基本任务是得到差异分析结果，进...
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有没有破解版软件？
SnapGene简单入手(一)
“SnapGene是模拟质粒构建的利器。” SnapGene是一款功能强大的多功能的分子生物学工具，能够非常直观的注释分析和DNA图谱，用于创建和共享丰富的注释文件，帮助我们...
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R语言分析qPCR结果应实验室同学的需求，为了减轻他们计算结果的工作量，来编写了以下的R语言代码，利用单因素方差分析（多重比较分析）分析qPCR的Ct值，并绘制表达量柱状图。 方差分析用于两个及两...
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viroblast的安装目录下data文件夹没有写的权限，chmod a+w data就可以了
建立本地的可视化blast页面
我们实验室主要是研究拟南芥的，因此要经常进tair网站，但是有时进的比较慢或者完全打不开，而NCBI也比较慢，所以我想建立一个本地的可视化的blast网站，以viroBlas...
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bugu_默 ·作者您好，我按照您这个方法配置了blast，页面是可以显示出来的，但是最终用序列进项blast时网页显示Error: couldn't open ./data/162988579159.blastinput.txt，，这个是怎么回事呀，求助。
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科研绘图的主题与颜色搭配主题 除了 theme_bw() 以外，下面主题也适合科研绘图。ggplot2 自带主题：https://ggplot2.tidyverse.org/reference/gg...
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ggplot2-火山图读取数据 先画个基本的 添加上阈值线 给感兴趣的基因加上标签 基因课网址https://genek-pc.duanshu.com/[https://genek-pc.duan...
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如何从vcf文件中批量提取一系列基因的SNP位点？
需求 客户的一个简单需求： 我有一批功能基因位点，想从重测序的群体材料中找到这些位点，如何批量快速获得？ 示例文件 gene.txt test.vcf 代码实现 run.sh...
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个人博客: xuzhougeng.top (随缘访问)
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miRNA-seq数据分析——学习笔记
@(我的第一个笔记本)[马克飞象, 帮助, Markdown] —bugu，2020.11.16记录miRNA-seq数据分析方法 ，参考jm生信技能树的—— 构建miRNA...
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文献解读--通过RNA测序解析玉米籽粒复杂的调控网络1. 文章概述 本篇要解读的文献是一篇发表较早，却比较经典的文章。是2013发表于 Nature Communication 上的一篇 eQTL的文章。 玉米基因组非常复杂，...
