我2017年用的域名失效了，我之前那个网站也没用了，所以这篇文章之前提供的链接跳转不过去。我现在直接在简书提供全文，然后新的链接是：https://www.shixiangw...
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【r<-生信|芯片分析】Bioconductor分析基因芯片数据 -
lncRNA,miRNA,mRNA互作通过lncRNA获得结合的miRNA（3个miRNA预测数据库中都存在），再获得miRNA作用的靶基因mRNA，靶基因mRNA与任一肿瘤差异mRNA取交集，交集mRNA与其相...
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TCGA——数据整理（FPKM到TPM）
0.安装包 1、下载好HTseq-FPKM的TCGA数据 2、将所有文件夹下的压缩包复制到一个文件夹下 3、解压缩到同一文件夹#gunzip()函数 4、提取藏在metada...
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肿瘤微环境在癌症中的作用在过去数十年中，通过使用免疫疗法、靶向疗法和联合方案，癌症治疗领域取得了前所未有的进步。但这些治疗方案中的绝大多数最终都无法治愈患者，甚至对治疗有显著初始反应的肿瘤也经常复发...
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STEP6:WGCNA相关性分析因为样本数量比较可观，所以可以进行WGCNA分析。这里是并不需要选取所有的基因来做WGCNA分析，挑选的标准可以是top变异程度大的基因集合，或者显著差异表达的基因集合等等。...
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WGCNA学习：WGCNA分析实战WGCNA笔记第三弹 WGCNA分析原理 WGCNA应用场景 WGCNA分析实践 本代码借鉴了生信技能树的WGCNA教程以及PlanTech的WGCNA课程编写，转载请注明出...
