240 发简信
无言89
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    SAM/BAM的CIGAR难点

    刘小泽写于2020.4.6记录一个小知识点，比对后SAM/BAM的CIGAR这一列中的含义，重点是soft clipping 和 hard clipping的理解 首先了解S...

    刘小泽
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    专利培训课程笔记

    第一节 发明创新的基本概念 什么是发明创新三种类型：发明、实用新型、外观设计 权利要求是什么权利要求书说明书说明书附图 第二节 专利文献阅读 阅读顺序泛读----摘要、附图摘...

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    更新AnnotationHub对应数据库

    最近在使用AnnotationHub下载Orgdb数据时遇到了一个问题，使用模块更新数据后发现日期停留在了2018年，数据没有更新。现在很多分析依赖数据库数据，如果不更新，分...

    xiaoji_hb
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    MAC OS M1安装R包遇到的坑。。。

    巨坑：十一长假没出门，宅在家里无聊时突然想给自己个人电脑上的R升个级。。。本来觉得这是个很简单的事！从R官网[https://cran.r-project.org]下载个最新...

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    一个好用的vim插件----shellcheck安装

    今天在公众号推送中发现了一个挺好的vim编辑器插件：shellcheck shellcheck 是一款实用的 shell脚本静态检查工具。首先，可以帮助你提前发现并修复简单的...

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    RNA-seq(5):序列比对：Hisat2

    比对软件很多，首先大家去收集一下，因为我们是带大家入门，请统一用hisat2(官网https://ccb.jhu.edu/software/hisat2/index.shtm...

    Y大宽
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    stringr 安装失败的解决办法

    最近有个任务要在新服务器上安装R包，stringr是其中之一新服务器的R版本是4.0.5，比我之前使用的4.0.2高一些 不知道是不是版本问题，在其他服务器上只要一条inst...

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    用conda下载安装gatk3.8并注册

    现在gatk已经更新到gatk4了，但是gatk3.8还是有很多应用的场景，比如指定多线程，并且有些功能在gatk4里找不到（也可能是我道行浅）所以记录一下之前如何安装和注册...

    卖萌哥
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    vep使用初探

    VEP（Variant Effect Predictor）官网教程：https://grch37.ensembl.org/info/docs/tools/vep/script...

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    CNV检测工具--CNVkit

    CNVkit是一个新的检测基因组结构变异的工具，适合用来处理同一批次多个肿瘤配对样本的数据 安装： 需要python3.9以上版本，推荐用conda安装 安装conda/Mi...

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    linux命令后台执行的方法

    自从做生信以来，总有那么几次，敲下回车后发现这个command执行的时间远超过预期。眼看着下班时间到了，进程还没有结束。又不舍得直接kill，毕竟已经耗费了那么多机时。 求助...

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    【转】R画图的时候出现“null device 1”

    R画图的时候出现null device 问题 在运行上面R代码画饼图的时候会在命令输出窗口里面显示： 虽然图片是输出了，但是这个报错不知道是什么问题导致的。 解决办法 把之前...

    白菜代码小推车
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