本节简单介绍Aspera安装和使用,并给出利用SRR号批量下载FASTQ或SRA数据的方法,通过比较发现aspera的下载速度与prefetch相比有了质的飞跃 前言:我们下...
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1. Kaplan-Meier生存分析 Kaplan Meier是一种单因素生存分析,它可用于研究1个因素对于生存时间的影响。参考:生存分析之Kaplan-Meier曲线都告...
参考教程:http://www.sthda.com/english/wiki/survival-analysis-basics[http://www.sthda.com/en...
2023-6-13更新 太大的数据还是放弃下载吧几个月过去,本来以为pyega3不行的话ascp肯定行结果43T下载下来17T,c4gh解码失败了一半有这些时间干点啥不好,裂...
练习数据集的GEO编号:GSE139324 (Immune Landscape of Viral- and Carcinogen-Driven Head and Neck C...
10x平台的双细胞率(符合泊松分布1): 根据Poisson分布,单个液滴包含超过一个细胞(doublets或multiplets)的频率随着上机细胞的浓度而改变。通常如果上...
影响因子:5.8 研究概述: 骨关节炎(Osteoarthritis, OA)是一种退行性炎症性关节疾病,是致残的主要原因,以长时间活动后的关节疼痛和僵硬为特征;Anoiki...
ORA富集分析只需要提供差异基因列表,GSEA富集分析还需要提供对应差异倍数信息。但二者都是基于差异分析得到的结果。Gene set variation analysis (...
ESTIMATE计算免疫基质得分以及肿瘤纯度 1.概述 Estimate根据转录组数据来计算免疫基质得分,也可得到肿瘤样本的肿瘤纯度 其原理本质上是先收集好免疫基因集和基质基...