早些时候由于工作条件和需要，在电脑上安装了双系统。目前工作条件改善了，有了开发工控机，就不要PC上的Ubuntu系统了。 首先查看系统信息： 我的PC为UEFI的方式，直接采...
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win+ubuntu双系统删除Ubuntu
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GWAS表型数据处理参考：多年多点数据如何计算遗传力以及BLUP值[https://blog.csdn.net/yijiaobani/article/details/90215314]如何计算多...
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从表达量矩阵求各处理组的平均值（勘误版）
上一篇文章我提到了从表达量矩阵画时序性（或者多处理）的单基因的折线图，实际上我们的表达量矩阵里面每个处理是有2-3个重复的。所以用来画折线图的矩阵应该是合并了重复，求得平均值...
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每周文献 2022-05-02大家好，本周给大家分享的是最近发表在NG上与油菜育种中农艺性状的基因组选择和遗传结构相关的一篇文章。 文章题目：Genomic selection and genetic a...
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基因组survey分析
基因组survey分析内容 基因组Survey基于小片段文库的低深度测序数据(50X-100X ) ; 通过K-mer分析 ,有效的评估基因组大小、GC含量、杂合度以及重复序...
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生信 | 基因组组装实战（一）：基础知识与基本思路写在前面 以下内容均来自菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班课堂笔记 1. Genome de nove 基础知...
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FastqCount的安装与使用
FastqCount (https://github.com/zhimenggan/FastqCount)[https://github.com/zhimenggan/Fas...
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基因家族分析7 || 顺式作用元件分析第六部分暂时发现一点问题，改天补充~ 基因家族流程：基因家族分析（一）[https://www.jianshu.com/p/34333a6d7c4e] 基因家族流程：基因家族...
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Bioinformatics Workbook：一个生信学习网站 | 不需要翻 | 示例数据+代码> 推荐一个生信学习网站：`Bioinformatics Workbook` > 网站地址：https://bioinformaticsworkbook.org/[https...
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ggplot2绘制带有标准差图ggplot2-为折线图和条形图添加误差线 以ToothGrowth数据为例,进行处理 tg <- ToothGrowth head(tg) library(ggplot2)...
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[R] 添加误差棒的分组折线图：geom_path: Each group consists of only one observation. Do you need to adjust the...想做一个简单的分组折线图，并添加误差棒，类似下面这样的： 计算误差需要安装Rmisc包中的summarySE函数。 数据变成这样： 接下来就是作图了。 得到警告： 我想了想，...
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利用ggplot2绘制折线图（均值+误差棒）由于实验需要，帮师姐画了一张折线图。特此感谢师姐提供数据给我锻炼的机会！ 成品图如下 直接上代码 1. 读入数据 2. 计算标准差 3. 绘制折线图 结果如图所示，从图中可以...
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WGS全流程的学习笔记
Part1 数据下载 先去Korean Personal Genome Project下载了编号为KPGP-00001的数据。 先说一下KPGP吧，中文名叫韩国个人基因组计...
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14.GO富集分析R语言代码及5种图的绘制一、举例回顾 本节使用GSE1009数据集，已经用limma包对数据集中的样本进行差异分析，现对差异基因(DEGs)做GO富集分析。 GSE1009数据集介绍： 样本量：共6...
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GWAS 总体流程理解版
自己找了一些文章和视频，先总结了一部分，后面再做补充和实操 一. 相关概念理解 （1）GWAS： 全称“全基因组关联分析”，使用统计模型找到与性状关联的位点，用于分子标记选择...
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重测序-棉花GWAS助力Nature Genetics
GWAS+转录组：从单一组学到组学，为作物育种开启更多的切入点，挖掘作物研究作物研究新亮点。利用多种技术，相辅相成，精确定位基因，层层敲定新基因。 研究背景：对棉花基因组变异...
