史智凌

前言 今日份看文献《SCENIC: single-cell regulatory network inference and clustering》[https://www....

史智凌

解决方法 更改clusterProfiler包的源码并重新编译 下载源码： Bioconductor - clusterProfiler[https://www.biocon...

史智凌

背景和说明 作为第二大脑系统的笔记软件，本片我们来讲一下Obsidian的基本使用和配置。关于“第二大脑系统笔记方法选择和软件选型”我会单独写一篇Bolg进行说明。作为第二大...

史智凌

为什么有些人总是能发好几篇纯生信SCI？因为人家掌握了方法，例如利用同一份GEO数据可以发两篇SCI，具体操作如下： 第一篇纯生信SCI可以这样做： 第一步，数据下载处理、合...

史智凌

原文：这篇文章是18年4月发表在Cell上的， 原文链接: Integrated Single-Cell Analysis Maps the Continuous Regul...

史智凌

前面给大家介绍过主成分分析 ☞R做PCA主成分分析[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin.qq.com/s%3F...

史智凌

论文 https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867421008916#da0010[https://w...

史智凌

计算每个细胞的CNV score或者判断每个细胞是否是癌细胞 文献《Single-cell RNA-seq highlights intra-tumoral heteroge...

史智凌

2021年1月28日，得克萨斯大学西南医学中心吴军博士团队联合中山大学附属第一医院、深圳华大生命科学研究院等机构科学家团队在《自然》（Nature）杂志上联合发表题为“Cel...

史智凌

大家好，我是Peter~ 今天给大家带来的是一篇关于Plotly绘图的文章：如何使用Plotly来绘制矩形树状图 Plotly文章 目前Plotly的文章更新到第17篇，推荐...

史智凌

hello，大家好，今天我们来分享一个10X单细胞和VDJ联合分析的方法，PlatypusDB，关于转录组和VDJ联合分析的方法，之前也分享了不少了，这篇文章参考于Platy...

史智凌

Cell Ranger是一个“傻瓜”软件，你只需提供原始的fastq文件，它就会返回feature-barcode表达矩阵。为啥不说是gene-cell，举个例子，cell ...

史智凌

单细胞富集分析系列： 单细胞之富集分析-1：单细胞GSEA分析流程[https://www.jianshu.com/p/00f069cb239c] 1. 背景 Gene Se...