CD8 1. annotation. 1.1 Classical markers T cells' annotation can be highly rely on the ...
发简信
IP属地：山东
-
T cell analysis -
windows中密钥的权限
简单描述问题：在使用vscode通过ssh-remote链接远程服务器的时候，尽管在ssh配置文件config中设置了正确的密钥目录，仍然无法连接并提示： Permissio...
-
cell2fate流程探索1. 简介 cell2fate是一个用于velocity分析的软件，相比传统的scvelo建模方法，能建立更符合生物学过程的时序，详情可阅读原文：Cell2fate infe...
-
tmux+jupyter-notebook后台保存python运行空间1. jupyter-notebook安装 Project Jupyter | Installing Jupyter[https://jupyter.org/install]...
-
解决error：CUDA error: no kernel image is available for execution on the device
1. 问题概述 在python中利用pytorch+cuda调用GPU进行训练的时候，报错： 2. 社区资料 该报错比较常见，已有多个社区博客提供了解决方案： 2.1 by ...
-
The calculation of modulescore in Seurat
The Module Score calculation is designed to refine the mean expression of a gene signat...
-
several facts of SCENIC
1. GENIE3对于输入的expression matrix，既可以是UMI counts，也可以是library-size normalized counts，两者的结果...
-
The process of SCENICLast week we learned Transcription factor motif finding, also, recently I was using SCE...
-
fastMNN and harmonyIn analyzing scRNA-seq data, batch effects are an influential source of variability. Th...
-
TRUST4免疫组库分析
作者：Resther审稿：童蒙编辑：angelica 1.背景介绍 人体淋巴细胞主要包括T细胞、B细胞。B细胞约占外周淋巴细胞总数的20%，其主要功能是产生抗体介导体液免疫应...
-
FindAllMarkers, FindMarkers 以及 FindConservedMarkers 的区别
在seurat中，如果运行了RunUMAP或者RunTSNE后自动分群后，FindAllMarkers和FindMarkers基本就是一样的；如果没有进行RunUMAP或者R...
-
2023-04-20 细胞器的marker需要对细胞器进行分离，查了一些资料，比较好看，贴上来。 1. Thermo 海报：细胞器标记物抗体和细胞染色剂[https://assets.thermofisher.cn/...
-
如何获取kegg通路的基因列表
如何获取kegg通路的基因列表？相信很多人都有这个疑惑。 哪些时候需要知道通路的基因列表？举两个例子： 在找差异基因这一步，只想针对特定通路的基因去找。可以在找完差异基因后，...
-
错误解决：Error: Failed to install 'SeuratWrappers' from local: Failed to connect to api.github.com ...
通过remotes::install_github函数安装github上的包时报错： 我尝试很久没法解决，选择手动下载zip包后上传至服务器，然后local安装，仍然报错： ...
-
RNA velocity of single cells文献学习在之前的一个视频学习系列笔记里，有一篇笔记提到了RNA velocity（Single cell RNA-seq data analysis with R视频学习笔记（八））...
-
赶紧抢发双硫死亡生信SCI，一秒都不能迟
如果你2022年错过了铜死亡生信，不要灰心，2023年一样会给你带来新热点，这个热点就是双硫死亡（Disulfidptosis），Disulfidptosis是2023年新发...
-
单细胞空间数据分析之CNV进化树作者，Evil Genius 时光荏苒，2022年也即将结束，这一年，单细胞空间多组学技术进一步带领我们走入生物组织的微观世界。单细胞多组学的技术发展让研究人员可以从单个细胞...
-
单细胞注释-marker参考
A Guide to T Cell Markers[https://www.biocompare.com/Editorial-Articles/569888-A-Guide-...