三者的区别训练集(train set) —— 用于模型拟合的数据样本。验证集(development set)—— 是模型训练过程中单独留出的样本集,它可以用于调整模型的超参...
直接下载该数据集的GEO series matrix 数据 ---- 如果是直接下载表达矩阵的话(大多数已经进行标准化和背景校正) 可以查看一下处理是否得当
本文采用GSE7014数据集作为示例数据集删除了35-44样本,仅保留26个样本进行计算分为T2DM和Control组 首先下载CEl文件和准备Targets文件 第一步提取...
Linux环境下的软件安装 第一部分:下载安装miniconda 第二部分:使用conda 以fastqc软件为例 第三部分:conda环境 多重环境可以使用不同版本的软件,...
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第一步_安装和加载R包 01_设置镜像 02_安装R包 安装R包使用的函数取决于下载的地址 03_加载R包 第二步_dplyr包的五个基础函数 dplyr两个实用技能 dpl...
向量 1标量和向量 2从向量中提取元素 数据框 报错save(x,file="test.Rdata")说明x这个变量不存在,找到定义x变量的位置,检查原因
作图 R基本操作 工作路径设置 查看工作目录:getwd()更改工作目录:setwd() 查看工作路径的文件 两者作用相同 计算 赋值 使用<-a <- 1+2意思是把1+2...
markdown格式使用 标题 标题的使用直接在文本前加入#一级标题 #二级标题 ##三级标题 ###以此类推 加粗和斜体 粗体:(粗体,左右加上**) ;粗体 斜体:(斜体...
主成分分析(principal component analysis,PCA)是一种常见的数据降维方法:目的是减少数据集的维数,同时保持数据集中的对方差贡献最大的特征,即在“...
参考教程:微信公众号:生信星球批次效应处理实例:combat和removebatcheffect的对比 特别感谢:人美心善爱护小白的花花老师小洁忘了怎么分身 作为一个非常想搞...
从全部差异基因筛选出一定阈值(FC,P值)筛选以后得到差异基因,再从所有差异基因的表达矩阵中筛选出最终差异基因的表达矩阵操作 使用EXCEL的VLOOK函数 文章参考链接 h...
R语言_Affymetrix芯片数据处理 采用数据集GSE66360 ##设置工作路径(事先放好原始数据,分组信息,注释文件) setwd("/Users/apple/Des...