遇到的问题： 生存分析进行过程中，一直发生报错，代码及 错误如下： ggsurvplot(fit)Error in data.frame(..., check.names =...
发简信
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生存曲线绘制出现Error in data.frame(..., check.names = FALSE) : arguments imply differing number of r... -
GDC Data Transfer Tool 下载TCGA数据一、GDC Data Transfer Tool下载 GDC Data Transfer Tool是TCGA官方基于python开发的下载程序，在TCGA官网GDC部分可以找...
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R语言 -- customLayout 包 拼图目标 使用R拼出这样的一张图： Let's start 1. 安装 customLayout 包 简单介绍一下 customLayout 包： lay_new(mat, wi...
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生存分析（二）-- Cox比例风险模型（Cox proportional-hazards model）翻译自：http://www.sthda.com/english/wiki/cox-proportional-hazards-model[http://www.sthda.c...
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肿瘤分子亚型/分型的含义及目的肿瘤分子分型(molecular classification)由美国国立癌症研究所首次提出，通过分子分析技术为肿瘤进行分类，使肿瘤分类从传统的形态学转向以分子特征为基础的分...
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TCGA+biomarker——决策曲线分析法（DCA）
DCA曲线简介 DCA是一种评估临床预测模型、诊断试验和分子标记物的简单方法。传统的诊断试验指标如：敏感性，特异性和ROC曲线下面积仅测量预测模型的诊断准确性，未能考虑特定模...
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R语言| 连续变量取cutoff值：基于KM曲线欢迎大家关注我的公众号：一只勤奋的科研喵[http://mp.weixin.qq.com/mp/homepage?__biz=Mzg2MjU2NDQwMg==&hid=2&s...
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COX回归之nomogram列线图看到丫姐画完这篇1区28分JCO里所有的图这篇推文后，对里面出现的nomogram列线图以及用于评价模型的图十分眼馋，于是决定试着画画看 1. 使用rms包的cph()建立c...
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2020-01-08单因素COX分析和建立模型
cox_t<-cox_train[,-c(1:9)] cox_t<-log2(cox_t+0.1)###记得查看结果，是否有NAN，很奇快，没项独立运输没有NAN，但这一句一...
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2019-12-13 小白新手笔记 GEO数据库下载及ID转换
GEO数据库下载 library(Biobase) library(BiocGenerics) library(parallel) library(GEOquery) ges...
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GEO挖掘实战二、差异分析及富集分析「生信技能树」三阴性乳腺癌表达矩阵探索 系列笔记GEO挖掘实战一、初步探索数据 - 简书GEO挖掘实战二、差异分析及富集分析 - 简书GEO挖掘实战三、GSVA - 简书GE...
