这篇文章的目的是为了帮助理解Seurat在单细胞转录组分析中可以做哪些事,并且对整体的数据分析流程有一个整体的认识。并不包含代码。转载请注明出处 1.单细胞测序分析的整体流程...
这篇文章的目的是为了帮助理解Seurat在单细胞转录组分析中可以做哪些事,并且对整体的数据分析流程有一个整体的认识。并不包含代码。转载请注明出处 1.单细胞测序分析的整体流程...
写在前面 近期辅助课题组成员做一些上游数据分析,于是跑了前面搭建的流程并准备了系列分析结果文件,大体如下: 在其中「差异表达分析」的文件夹中,有系列文件,包括 KEGG Pa...
当我们拿到基因表达数据之后,主要使用过表达分析(ORA)和基因集富集分析(GSEA)来探索基因的功能,有的时候还需要挑感兴趣的通路画图(热图、GSEA图之类的),借用Y叔Cl...
一行代码绘制火山图的R包诞生了!在过去的一年中,师兄先后生信绘图系列和高分SCI复现系列中更新了多种不同的火山图的绘制方法,包括普通的火山图、渐变火山图、以及包含GO通路信息...
有了R语言的基础,以及ggplot2绘图基础,我们的生信常用分析图形的绘制就可以提上日程了!本系列,师兄就开始带着大家一起学习如何用R语言绘制我们自己的各种分析图吧! 由于本...
通过 KEGG 富集分析得到通路图非常模糊,无法直接用于文章发表。而我们在一些大佬的文章里看到的通路图却非常漂亮,如下,很明显,这样个性化的通路图是作者花心思重新绘制的。 那...
只有基因组,想画一个代谢图,折腾了好几天,最后发现仔细看官网文档是最快的,网页搜到的很少有详细讲解的,大多都是只讲一个部分,所以老老实实看官网是最快的。当然若是能检索到中文的...
Identification of Potential Key Genes for Pathogenesis and Prognosis in Prostate Cancer...
今天是不用学代码利用生信软件联合“点点点”就可以取得hub基因的“白痴”实操,赶快点起来~ Hub基因(关键基因)是在生物学过程中发挥重要作用的基因,它往往在通路中为主导地位...