双细胞是指由于实验原因，在单细胞微流控等流程中某个液滴中含有2个及以上的细胞，而在同一个液滴中的细胞在后续分析中带有相同的Cell Barcode，从而会被认为是一个细胞的伪...
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单细胞数据分析笔记3: 双细胞去除（DoubletFinder, scDblFinder) -
单细胞转录组双细胞判别软件scDblFinder起因：最近有个问题样本，跑完cellranger，样本的cellranger结果如下，细胞数目极高(3W+)。在后续数据质控分析中，线粒体基因占比和双细胞率均很高，用scDb...
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ggplot2学习（四）ggplot2基础（4）——主题 ggplot2基础（1）[https://www.jianshu.com/p/06a5763de24a]ggplot2基础（2）——坐标轴[...
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RNA velocity分析练习（四）聚类以及velocity可视化系列回顾：1.RNA velocity分析练习（一）文件下载以及预处理2.RNA velocity分析练习（二）软件安装3.RNA velocity分析练习（三）生成loom...
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【shell笔记>命令】linux简单命令速览
ls -F可以轻松区分文件和目录 ls -F -R -R为递归选项，它会列出当前目录 ?表示一个字符 *代表0或多个字符 cp -i会询问是否覆盖已有文件 cp -R可以递归...
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玉米全基因关联分析 ( GWAS Analysis Pipeline )全基因组关联分析是基于数量性状连锁不平衡理论，通过表型与基因型关联分析获得影响表型性状的显著关联标记。 1. 软件 Tassel / Gaipt / FarmCPU / mr...
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如何理解GWAS中Manhattan plot和QQ plot所传递的信息在GWAS研究中，Manhattan plot和QQ plot是最常画的两类图，它们可以把跟研究的性状（比如，基因型和身高）显著相关的基因位点清晰地展现出来，不少读者朋友应该...
