您好 想问下assembly数据在mitofinder也注释不全,除了下载对应SRA文件重新组装再注释还有其他方法吗😭
线粒体组装软件Mitofinder安装与使用下载与安装如下,官网https://github.com/RemiAllio/MitoFinder[https://github.com/RemiAllio/MitoFind...
您好 想问下assembly数据在mitofinder也注释不全,除了下载对应SRA文件重新组装再注释还有其他方法吗😭
线粒体组装软件Mitofinder安装与使用下载与安装如下,官网https://github.com/RemiAllio/MitoFinder[https://github.com/RemiAllio/MitoFind...
您好 我想问下assembly数据在mitofinder也注释不全,除了下载对应SRA文件重新组装再注释还有其他方法吗😭
线粒体基因组的组装和注释(MitoFinder )之前有过用二代测序的数据组装植物叶绿体基因组昆虫线粒体的经历,用的是单位的超算(Linux系统)。 这里的二代测序数据是全基因组的浅层测序数据,因为叶绿体和线粒体是多拷贝的,...
您好 对于assembly数据 我是不是需要下载fasta文件呀,然后再自己注释嘛
如何下载基因组注释文件和复制链接(以GCA_000817325.1为例)进入NCBI,search 这样就可以直接下载基因组注释文件啦 如何得到基因组注释文件的链接? 下载 wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/ge...
您好我想问一下 assembly数据没有找到对应的SRA数据该怎么办呢
GEO数据挖掘(一)下载SRA库原始测序数据对于很多生命科学研究人员来说,经常会面临这样的问题:“不知该从哪个基因入手研究、有感兴趣的基因但不知道如何深入研究、不知道如何整合某一类疾病研究领域的数据进行分析”。这些困扰...
SRA(Sequence Read Archive)数据库是用于存储二代测序的原始数据的数据库。除了原始序列数据外,SRA现在也存在raw reads在参考基因的比对信息。 ...
文章:grabseqs: simple downloading of reads and metadata from multiple next-generation seq...