1.课程回顾 例1：房价和面积—预测 给定一组房价和房屋面积的数据集，通过机器学习算法(监督学习)来拟合画出一条线，根据这条线来对未知的数据进行判断。 假设机器通过这些房价数...
IP属地：广东
-
【吴恩达机器学习】第一周—单变量线性回归 -
文章同步发表在：<br>1.公众号：SunFlow007<br>2.知乎：Lyon<br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.zhihu.com%2Fpeople%2Fbetter-man007%2Fcolumns" target="_blank">https://www.zhihu.com/people/better-man007/columns</a><br>
-
-
跟着Nature Communication学数据分析：R语言利用宏基因组的相对丰度数据做主坐标分析（PcoA)）论文 Microbiomes in the Challenger Deep slope and bottom-axis sediments https://www.natur...
-
宏基因组 + 宏转录组分析工具：HUMAnN导读 HUMAnN（全称HMP Unified Metabolic Analysis Network）最早由Curtis Huttenhower团队针对HMP项目开发的一款可...
-
MGCA：微生物基因组组分与注释管道MGCA Microbial genome component and annotation pipeline Introduction The software under...
-
CAZy碳水化合物活性酶预测CAZy数据库简介 CAZy 全称为Carbohydrate-Active enZYmes Database，碳水化合物酶相关的专业数据库，内容包括能催化碳水化合物降解、修饰...
-
PGCGAP v1.0.35版本更新
PGCGAP 是用于原核生物基因组学和比较基因组学分析管道，目前该管道包含 12 个模块，可以接受 Illumina 双端 reads、Oxford reads 或 PacB...
-
利用PGCGAP根据ids提利用PGCGAP根据id提取序列信息
使用场景 假设有一个 fasta 格式的序列文件SRR9620252.faa，我们想要提取其中的一些序列到一个新的文件中，我们拥有这些序列的 id （假设这些 id 存放在文...
-
Cannot connect to the Docker daemon at tcp://localhost:2375. Is the docker daemon running?
docker本地默认是unix socket，这里报错是使用了tcp，默认情况下，Unix的socket属于用户root，其它用户要使用要通过sudo命令。由于这个原因，do...
-
@朱橘橘 现在一般都不用虚拟机了，Bio-linux应该也是多年未更新了吧。如果是WIN10系统，可以直接安装WSL，自己装软件。可参考我的另一篇文章，有视频教程（https://protocolexchange.researchsquare.com/article/pex-807/v5）
生物信息学1：虚拟机 & Bio-linux安装与配置
前言：大家按照步骤从头看到尾，末尾有常见错误解决办法，如果有其他问题，大家先看错误提示，根据提示自行百度，很多问题都可以得到解决，实在解决不了的可以问我，谢谢！找我远程的，先...
-
主程序就是压缩包里的“kSNP3”文件，可以用任何文本编辑器打开，还有问题可加群“生信之巅”
kSNP3寻找SNPs并构建进化树
1. kSNP3 安装 cd ~/toolswgethttps://sourceforge.net/projects/ksnp/files/kSNP3.1_Linux_pac...
-
R绘图脚本(python等绘图脚本)自适应图片大小的方法(plot ggplot png pdfggsave等)问题与适用性描述 绘图的时候一般是默认图背景大小或指定大小，但是多数图片需要展示的内容不是固定的，两种方法都会导致图片过大或过小，解决方法是根据图片内容自动设置背景大小，这里...
-
ggplot2优雅的绘制高端热图本节来介绍如何通过ggplot2绘制复杂热图 加载R包 加载数据 数据清洗 绘制热图 ggtree绘制聚类树 绘制样本分类色条 基因长度信息可视化 基因平均表达量可视化 展示...
