Introduction 此课程是Coursera上，John Hopkins University 的 Genomic Data Science的Course4，Cours...
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Genomic Data Science- JHU Course 4 Algorithm for DNA Sequencing 笔记 -
manta 鉴定SV
Manta Structural Variant Caller 详情：https://github.com/Illumina/manta[https://github.com...
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RNAseq-踩坑02 -- Aligment 比对率低RNAseq的第二步就是Aligment, 一般都是有参考基因组的比对，据同事介绍，比对这一步，比对率再80%以上才算是正常的，很多样本的比对结果都能达到90%以上。 然而，...
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跟着Nature Genetics学二代测序数据分析：使用NOVOPlasty组装生菜的叶绿体基因组论文是Whole-genome resequencing of 445 Lactuca accessions reveals the domestication histor...
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【linux】单行命令-第2部分：Bioinformatics one-liners
单行命令，化繁为简，重剑无锋，大巧不工。接下来学习生信实用单行命令。 基础awk和sed命令 sed: stream editor流编辑器 提取文件的2，4，5列： 输出文件...
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RNA-seq 可变剪切可变剪切定义 有些基因的一个mRNA前体通过不同的剪接方式（选择不同的剪接位点）产生不同的mRNA剪接异构体，这一过程称为可变剪接(或选择性剪接， alternative s...
