TCGA数据库中含有的癌症名称,简写和中文名称 Abbr英文名称中文名称ACCAdrenocortical carcinoma肾上腺皮质癌BLCABladder Urothe...
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jimmy布置的个R语言中级作业中提到了几个R包,我查找了Bioconductor中org.Hs.eg.db包的使用说明书,为了自己更好的理解和应用,做了以下笔记。 首先了解...
前段时间,我们对显著差异转录本Pathway富集进行了解读,。今天,我们再来看看GO分析,以及相关图表的意义。 GO分析网站:http://pantherdb.org/,以及...
理论知识 GSEA(Gene Set Enrichment Analysis),该方法发表于2005年的Gene set enrichment analysis: a kno...
如题,芒果必须告知各位果友这个不幸的消息——Oncomine数据平台将于2022年1月17日终止服务。关于Oncomine平台的离场,芒果很伤心,也很惋惜! 但是,现实总是残...
肿瘤微环境是近年来的研究热点。复杂而动态的微环境中,肿瘤细胞与浸润性免疫细胞、基质细胞等相互作用,这在促进或抑制肿瘤生长、侵袭、转移以及对病人临床预后方面可能具有多方面的影响...
GSEA缩写 GSEA的全称是Gene Set Enrichment Analysis,中文翻译就是基因集富集分析,最早提出GSEA的文章是下面的这篇文献: 基因集富集分析是...
教程https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI5MTcwNjA4NQ==&mid=2247484582&idx=1&sn=1e01276e121...
最近学习了生信菜鸟团的纯R代码实现ssGSEA算法评估肿瘤免疫浸润程度,想复制作者的流程,但是发现了几个不一样的地方,所以重新整理流程,代码主要来自原作者Juan_NF。 文...