导读 主成分分析（principal component analysis，PCA）是将多个变量通过线性变换以选出较少个数重要变量的一种多元统计分析方法，是常用的数据降维手段...
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R：prcomp做PCA -
Quantile Normalization转自：http://www.bio-info-trainee.com/2043.html 提到normalization很多人都烦了，几十种方法，而对于芯片或者其它表达数据来...
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R 数据可视化 02 | 火山图
一. 示例数据准备 下载：链接：https://pan.baidu.com/s/1tKR943efKOn7-TW_892KLg提取码：wbk6 文件说明示例数据，其中数据均为...
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[Journal]Inter-cellular CRISPR screens reveal regulators of cancer cell phagocytosisNew knowledge for me: sialic acids: protect cancer cells against innate immune cells ki...
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强强联合的基因ID转换刘小泽写于2020.5.28Ensemble转Symbol其实不是这么简单，问题百出，需要留意 0 今天遇到一个需求，先来看看 有这样的四个文件，每个文件中都有两列Ensem...
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感谢感谢！学到了
生信技能树中级20题
原题目链接：http://www.bio-info-trainee.com/3409.html原答案：http://bio-info-trainee.com/tmp/basi...
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R数据可视化10:蜜蜂图 Beeswarm忙碌于实验的一周。写代码的时候是只要写代码就要动脑子，最简单的读文件，也是要小小动一下脑子。而做实验的时候是计划实验的时候动脑子，实验中机械操作，然后实验失败的时候是费脑子。...
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TCGA癌症类型和样本代号解析之前分析TCGA数据都是直接匹配barcode，其规则懂的不多。相信有不少同志也有这方面困惑。 这里给出两份资料，一份是TCGA官方英文介绍，链接为https://wiki....
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2019-07-13 - TCGA胃癌的miRNA成熟体在肿瘤不同级别的表达图 (R)思路 首先要依据临床特征建立分组，无论是复发vs原发还是TNM分型中的T/N/M。将肿瘤每个样本的表型特征，与表达数据矩阵一一对应到同一张表格里来，随后再用作图工具出图。因为...
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2020-01-07-TCGA之RTCGATCGA数据的另一个重要的包：RTCGA参考学习资料：TCGA之miRNA预测临床表现RTCGA（1） 数据概况与数据下载RTCGA（2） 数据分析与可视化https://w...
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生信技能树《GEO数据框挖掘》笔记友情提示：一定要有R语言的基础，建议学习生信技能树的《生信人这样这样学R语言》之后（最好再把中级20题做完），再来学习本系列视频！总的来说，理解了R语言中级20题之后，这一块...
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生信技能树中级20题原题目链接：http://www.bio-info-trainee.com/3409.html原答案：http://bio-info-trainee.com/tmp/basi...
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2020-03-15关于叨叨记账： 早在半年前，在微博中看到有人分享叨叨记账中的聊天记录。这是一个以你所设置的idol的口吻与你聊天的记账软件，不得不说开发者很有想法，使用者以聊天的方式记账，...
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楼主的分享很棒，学到了很多。只是第7题有个小小的疑问，应该是先用%in%判断，再统计，table函数括号的位置好像有些不对
生信人的20个R语言习题及其答案-土豆学习笔记
生信人的20个R语言习题 http://www.bio-info-trainee.com/3409.html生信人的20个R语言习题 答案 http://www.bio-...
