Y大宽

使用cBioPortal进行复杂的癌症基因组和临床profiles整合分析（Y大宽原创，转载需要说明） 主要来自于doi:10.1158/2159-8290.CD-12-00...

名本无名

前言 前面，我们介绍过了差异基因的功能富集分析，今天，我们对这部分的内容作一些补充 主要介绍一下 GEVA、ssGSEA 和单基因的富集分析 GSVA 我们知道，GSEA 富...

庄小尽

zhuang_gj 2020/10/11 ssGSEA算法原理及应用[#ssgsea%E7%AE%97%E6%B3%95%E5%8E%9F%E7%90%86%E5%8F%8A...

谢京合

ssGSEA即单样本GSEA分析，主要可以用来量化免疫浸润。 免疫浸润是什么？要是直白的解释就是免疫细胞渗透到肿瘤组织的程度。一般我们说肿瘤组织当中的成分，首先想到的是肿瘤细...

黄晶_id

通过exprs函数获取表达矩阵后我们可以通过以下三种方法判断是否需要进行log2转换 1.肉眼识别 最简单粗暴的方法就是，根据数值大小粗略估计：如果表达量的数值在50以内，通...

面面的徐爷

前言 在处理数据的时候，经常会遇到两个名词Scale和Normalization，这两个名词经常会被混杂着使用，让我在理解一些操作的时候经常会迷糊，那么我就结合R语言里面的s...

天地本无心

出来画图，难免碰到个画箭头的需求。 简单，如下的代码就能安排。 画箭头时一些调整和参数设置，可以参考如下代码，看看箭头的头和尾的圆或者钝怎么设置。