R语言报错，没有重复的某一列成为行名，总是报错 解决方案-把数据框转变成matrix
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Error in `.rowNamesDF<-`(x, value = value) : missing values in 'row.names' are not allowed -
R包报错-错误: package or namespace load failed for ‘org.Hs.eg.db’: loadNamespace()里算'org.Hs.eg.db'时.o...
错误: package or namespace load failed for ‘org.Hs.eg.db’:loadNamespace()里算'org.Hs.eg.db'...
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R包报错-Error in `ggplot_add()`
报错内容如下： Error in ggplot_add():! Can't add o to a ggplot object.Run rlang::last_error() ...
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MapQuery error in Seurat reference mapping运行MapQuery函数遇到的问题： 在GitHub上搜到的回答者： 理解是这个包对应的uwot版本需要更改下就可以了 解决方法：重新更换这个版本的包，然后再重新启动Rstu...
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生信阿拉丁，为实用而生
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文件处理-Linux
1 .zip 文件 zip压缩文件 .zip文件解压缩 2 .gz 文件 gzip, gunzip, zcat - compress or expand files 3 .t...
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交并补-Linux
(1)两个文件的交集，并集前提条件：每个文件中不得有重复行 取出两个文件的并集(重复的行只保留一份) 取出两个文件的交集(只留下同时存在于两个文件中的文件) 删除交集，留下其...
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cellranger-初见
安装软件 下载人的参考基因组 10×官网给定的 添加软件目录到环境中 运行测试 https://support.10xgenomics.com/single-cell-gen...
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空间转录组测序学习-样本准备和建库内容来自视频，网址附后 主要内容如下 Tissue Prepartaion and Compatibility Sequencing Minimum Sequencing D...
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single_cell RNA BAM 文件Single cells, reverse transcription (RT) reagents, Gel Beads containing barcoded olig...
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执行这个命令可以解决上述报错问题
sudo apt-get install gawkscDAPA:从单细胞转录组数据中检测可变聚腺苷酸化（APA）
多聚腺苷化（polyadenylation，poly(A)）是转录本成熟过程中在3＇末端发生的重要修饰步骤。选择性多聚腺苷化（AlternativePoly(A)，APA）是...
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基因各种ID相互对应的获取使用这个网站-bioMarthttp://biomart.genenames.org/martform/#!/default/HGNC?datasets=hgnc_gene_...
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从官网获得BED文件可以从官网获得BED文件 http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgTables?command=start[http://genome.ucsc.e...
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Dapars寻找APA1.下载ref：https://github.com/ZhengXia/dapars/releases 2.github主页：https://github.com/Zheng...
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Chi-Square & Cramér’s V卡方独立检验-判断两类因子彼此相关或相互独立的假设检验 Step1: Chi-Square Independence Test - What Is It? The chi-s...
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gfold 分析之前分析遇到2个问题：1.样本只有一个，没有replicates，是不是就没有办法进行分析？2.一个样本有3个重复，另外一个只有1个，怎么进行分析？ Jimmy老师给出了提示...
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Error in makeContrasts(contrasts = c(comp), levels = design) : The levels must by syntacticall...前面的步骤是这样的： 使用limma包进行分析的过程中，出现的问题：Error in makeContrasts(contrasts = c(comp), levels = ...
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R报错-gather & spread 函数，有新版替代函数做一个练习题，以为很简单，但是却碰到问题 1.将iris数据框的前4列gather，然后还原 还原 错误: Each row of output must be identi...
