前言 上一节,我们介绍了如何绘制韦恩图来显示集合间的交叠关系 但是,随着集合的增多,韦恩图显示的关系会越来越复杂,很难一眼看出其中的信息。 今天,我们要介绍的是,当集合数目较...
前言 上一节,我们介绍了如何绘制韦恩图来显示集合间的交叠关系 但是,随着集合的增多,韦恩图显示的关系会越来越复杂,很难一眼看出其中的信息。 今天,我们要介绍的是,当集合数目较...
导读 venn可以分析不同数据集的交集,另外使用R语言UpSet函数包upset函数绘制集合图可以更清晰的展示不同数据集的交集情况。 下载,加载包 一、输入数据 二、集合图-...
有时候,我们从GEO数据库挖掘了好几组数据集的差异表达基因,我们需要统计这些基因列表的交集,一般可以用韦恩图和Upset图。而韦恩图一般适合小样本的交集,而多个样本的话可以用...
常见误区
@Jingle123 换个名字罢了
【转录组07】样本表达分布、相关性分析&差异表达分析一.样本表达分布 箱式图 小提琴图 概率密度分布图 以上三个图结合起来可以看总体样本表达分布图 二.样本的相关性 层次聚类树————通过计算点与点之间的空间距离对样本进行类别...
最近看到了一个小视频,教大家怎么命名自己的文件。看完之后深有感触,对于我这种没有调理的人来说,太有用了。希望自己以后可以不偷懒~现在花的时间是为了以后节省时间>_<https...
概述 细胞聚类:基于基因表达信息,将表达谱相近的细胞聚为一类,表达差别大的细胞彼此分开。 Seurat使用
参考学习资料:https://academic.oup.com/bioinformatics/article/34/14/2515/4917355之前看了技能树的系列推文和曾...
内容来自菲沙基因讲座。如有侵删 单细胞转录组建库原理 建库原理——3‘端【只做单细胞时使用】 建库原理——5‘端【与免疫组库有关时考虑】【看TCR和BCR】 单细胞转录组的应...
最近安装estimate、Bosg和maftools都遇见了截图的问题 搜索了一下,输入这两行代码就可以了
生存分析 COX回归 生存分析画图代码 生存分析前要进行数据的整理 生存分析只需要tumor数据,不要normal,将其去掉,新表达矩阵数据命名为exprSet; clini...
RNA-Seq差异表达分析-扩展综述及新工具 理解不同生物在不同条件下表型差异的关键是确定不同条件下差异表达基因(DEGs)。转录组的高通量测序(RNA-Seq)是研究当前问...
A survey of best practices for RNA-seq data analysis RNA-seq数据分析指南 内容 前言 各位同学/老师,大家好,现在...
8种特殊建库测序 8种特殊建库测序 1. RNA-seq 2. 外显子测序 3. small RNA-seq 4. 单细胞DNA测序 5. 单细胞mRNA测序 6. 甲基化测...