CellChat三部曲1：使用CellChat对单个数据集进行细胞间通讯分析 自从周运来在简书写了一篇cellchat的中文介绍教程，然后R包作者也在B站做了直播介绍，cel...
IP属地：北京
-
CellChat三部曲1：使用CellChat对单个数据集进行细胞间通讯分析 -
@799f94190138 不好意思，已经过了太久了，我不太记得了
hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)
官网：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...
-
h5ad文件转为seuratObject
报错：Unable to locate HDF5 compilation helper scripts 'h5cc' or 'h5pcc'.Please specify --...
-
用ggplot2画代谢集富集分析（MSEA）图MSEA 什么是MSEA MSEA，Metabolite Set Enrichment Analysis，代谢集富集分析，是代谢组数据分析方法的一种。MSEA是基因集富集分析...
-
单细胞长读长转录本异构体差异表达分析DIE软件——scisorseqr：https://github.com/noush-joglekar/scisorseqr[https://github.com/noush-jo...
-
自己写个小脚本吧，时间过了太久了我也记不清了
jcvi画两物种的共线性图
参考：https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version)[https://github.com/t...
-
rmats2sashimiplot安装及使用作用：二代数据用rmats-turbo跑完之后得到各exon的五种可变剪切事件和count数，用ramts2sashimiplot可视化。github网址：https://g...
-
@D低调en 你这个应该是各物种的CDS转成蛋白质序列，蛋白质序列cat在一起后比对，然后再用pal2nal.pl输入比对好的PEP和原始的所有物种cat在一起的CDS序列，得到正确位置的CDS序列，然后再构建系统发育树。个人见解，要不你试试？
hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)
官网：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...
-
R-fgsea包GSEA分析及可视化GSEA：（Gene Set Enrichment Analysis）基因集富集分析 基因集富集分析（GSEA）和基因富集分析（GO/KEGG）的区别： 基因富集分析是对已注...
-
嗯嗯是的
hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)
官网：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...
-
@zz_a46c 嗯嗯，最好是
hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)
官网：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...
-
序列ID是一样的吗？
hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)
官网：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...
-
ESPRESSO可变剪切分析使用说明ESPRESSO全称：Error Statistics PRomoted Evaluator of Splice Site Options，一种处理long read RNA...
-
-
【10X空间转录组Visium】（三）跑通Visium全流程记录旧号无故被封，小号再发一次 更多空间转录组文章： 1. 新版10X Visium 【10X空间转录组Visium】（一）Space Ranger 1.0.0(更新于20191...
-
强化学习基础知识详解强化学习（Reinforcement Learning） 强化学习基本概念 强化学习四要素：状态(state)、动作(action)、策略（policy）、奖励(reward...
-
AI数学基础18——常见的正则化方法1，L2 regularization（权重衰减）L2正则化就是在代价函数后面再加上一个正则化项λ ，使得权重在更新的时候，乘以一个小于1的因子（1-a(λ/m))，这个可以...
-
请问为什么您觉得是用FUBAR呢？hyphy给出的模型中有三种类型的检测：site, branch, branch-site。site test 假设各个位点的dN/dS可能不同，但是一个位点在整个进化过程中具有稳定的dN/dS；branch test不考虑位点间的差异，但是不同的branch可能具有不同的dN/dS；branch-site test同时考虑两种情况，最后得到的可能是某些位点在某些分支上具有特别的dN/dS（e.g., dN/dS>1）。你想看的是branch中哪些site存在正选择，你应该选第三类呀，FUBAR应该是第一类吧？（在我的理解中）
hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)
官网：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...
-
Fludigm C1 单细胞自动制备系统今天要介绍的是世界首款商业化单细胞自动制备系统，10x genomics面市之前，C1是单细胞测序领域的龙头老大。不过，碍于细胞通量低（<1000），同时价格高！因此很快就被...
