软件——scisorseqr：https://github.com/noush-joglekar/scisorseqr[https://github.com/noush-jo...
IP属地：北京
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单细胞长读长转录本异构体差异表达分析DIE -
自己写个小脚本吧，时间过了太久了我也记不清了
jcvi画两物种的共线性图
参考：https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version)[https://github.com/t...
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rmats2sashimiplot安装及使用作用：二代数据用rmats-turbo跑完之后得到各exon的五种可变剪切事件和count数，用ramts2sashimiplot可视化。github网址：https://g...
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@D低调en 你这个应该是各物种的CDS转成蛋白质序列，蛋白质序列cat在一起后比对，然后再用pal2nal.pl输入比对好的PEP和原始的所有物种cat在一起的CDS序列，得到正确位置的CDS序列，然后再构建系统发育树。个人见解，要不你试试？
hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)
官网：http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...
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R-fgsea包GSEA分析及可视化GSEA：（Gene Set Enrichment Analysis）基因集富集分析 基因集富集分析（GSEA）和基因富集分析（GO/KEGG）的区别： 基因富集分析是对已注...
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嗯嗯是的
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@zz_a46c 嗯嗯，最好是
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序列ID是一样的吗？
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ESPRESSO可变剪切分析使用说明ESPRESSO全称：Error Statistics PRomoted Evaluator of Splice Site Options，一种处理long read RNA...
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【10X空间转录组Visium】（三）跑通Visium全流程记录旧号无故被封，小号再发一次 更多空间转录组文章： 1. 新版10X Visium 【10X空间转录组Visium】（一）Space Ranger 1.0.0(更新于20191...
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强化学习基础知识详解强化学习（Reinforcement Learning） 强化学习基本概念 强化学习四要素：状态(state)、动作(action)、策略（policy）、奖励(reward...
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AI数学基础18——常见的正则化方法1，L2 regularization（权重衰减）L2正则化就是在代价函数后面再加上一个正则化项λ ，使得权重在更新的时候，乘以一个小于1的因子（1-a(λ/m))，这个可以...
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请问为什么您觉得是用FUBAR呢？hyphy给出的模型中有三种类型的检测：site, branch, branch-site。site test 假设各个位点的dN/dS可能不同，但是一个位点在整个进化过程中具有稳定的dN/dS；branch test不考虑位点间的差异，但是不同的branch可能具有不同的dN/dS；branch-site test同时考虑两种情况，最后得到的可能是某些位点在某些分支上具有特别的dN/dS（e.g., dN/dS>1）。你想看的是branch中哪些site存在正选择，你应该选第三类呀，FUBAR应该是第一类吧？（在我的理解中）
hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)
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同源异构体(isoform)和转录变异体（transcript variant）
同源异构体(isoform)：由来自一个基因的mRNA前体因选择性剪接而产生多种mRNA，并翻译出多种蛋白，这些蛋白即为同源异构体。同一个基因的不同版本的蛋白。 转录变异体（...
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您好，您的图片全都上传失败了，希望有时间可以更新一下，麻烦您
链特异性建库测序原理
RNA-seq基本流程 下图是一个大概的RNA-seq基本流程 [图片上传失败...(image-8ca9c-1586161495252)] 把RNA破碎成小片段，然后将RN...
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链特异性建库如何区分正负链？写在前面的废话 经过这两周意外的断更，我明白了一个道理，人都是具有惯性的…… 两周没写公众号，我似乎都习惯了懒惰，文章不想更了，笔记也懒得记了。 但是我没忍住双十一的诱惑，一...
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【单细胞入门必读】单细胞RNA-seq技术和数据分析简介
Single-Cell RNA-Seq Technologies and Related Computational Data Analysis 单细胞RNA测序(scRNA...
