单细胞测序方法和原理系列: 1. 单细胞转录组建库原理:SMART、TargetAmp和10X genomics[https://www.jianshu.com/p/6c5d...
单细胞测序方法和原理系列: 1. 单细胞转录组建库原理:SMART、TargetAmp和10X genomics[https://www.jianshu.com/p/6c5d...
免疫组库(Immune Repertoire,IR)是指个体在某个特定时间其循环系统中所有多样性的T细胞和B细胞的总和,即V(D)J序列多样性的集合。免疫组库分析是指运用高通...
我们生活着的世界并非只有我们自己,而是有很多小于或大于我们的生物不断与我们交互着,有的让我们开心,有的使我们伤心。这就关系到一个本质的问题: 我是谁? 我是一个脑袋,一个躯体...
参考:https://changeo.readthedocs.io/en/stable/examples/igblast.html[https://changeo.readt...
是自己生成的,编辑样本名称及sam文件路径。在文中的“预备工作:准备samples.tsv文件”可以看到
ESPRESSO可变剪切分析使用说明ESPRESSO全称:Error Statistics PRomoted Evaluator of Splice Site Options,一种处理long read RNA...
CellChat三部曲1:使用CellChat对单个数据集进行细胞间通讯分析 自从周运来在简书写了一篇cellchat的中文介绍教程,然后R包作者也在B站做了直播介绍,cel...
@799f94190138 不好意思,已经过了太久了,我不太记得了
hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)官网:http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...
报错:Unable to locate HDF5 compilation helper scripts 'h5cc' or 'h5pcc'.Please specify --...
MSEA 什么是MSEA MSEA,Metabolite Set Enrichment Analysis,代谢集富集分析,是代谢组数据分析方法的一种。MSEA是基因集富集分析...
软件——scisorseqr:https://github.com/noush-joglekar/scisorseqr[https://github.com/noush-jo...
自己写个小脚本吧,时间过了太久了我也记不清了
jcvi画两物种的共线性图参考:https://github.com/tanghaibao/jcvi/wiki/MCscan-(Python-version)[https://github.com/t...
isoform usage是常见的RNA seq下游分析流程,常见的包也是DEXseq2。但是用它跑自己的数据一直报错,跑示例数据是能够work的。 网上很多教程都是对示例数...
作用:二代数据用rmats-turbo跑完之后得到各exon的五种可变剪切事件和count数,用ramts2sashimiplot可视化。github网址:https://g...
@D低调en 你这个应该是各物种的CDS转成蛋白质序列,蛋白质序列cat在一起后比对,然后再用pal2nal.pl输入比对好的PEP和原始的所有物种cat在一起的CDS序列,得到正确位置的CDS序列,然后再构建系统发育树。个人见解,要不你试试?
hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)官网:http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...
GSEA:(Gene Set Enrichment Analysis)基因集富集分析 基因集富集分析(GSEA)和基因富集分析(GO/KEGG)的区别: 基因富集分析是对已注...
嗯嗯是的
hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)官网:http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...
@zz_a46c 嗯嗯,最好是
hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)官网:http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...
序列ID是一样的吗?
hyphy计算选择压力(+pal2nal的使用)官网:http://www.hyphy.org/[http://www.hyphy.org/]http://www.bork.embl.de/pal2nal/[http://...
ESPRESSO全称:Error Statistics PRomoted Evaluator of Splice Site Options,一种处理long read RNA...
目的:使模型(e.g., MLP)不会退化成线性模型 ReLu 修正线性单元(Rectified linear unit,ReLu) 实现: 当输入为负时,ReLU函数的导数...