本文记录了:TCellSI这个工具的使用(R语言),平台是Linux。TCellSI: A novel method for T cell state assessment ...
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本文记录了:如何使用VS Code连接云服务器;进一步设置了,每一次登录时无需再次“选择平台”和“输入密码”。 如何使用VS Code连接云服务器 安装插件【Remote -...
本文记录了:个人在生信分析的感悟,也记录了一些自我认为该提升的地方。 生信分析分为这5部分 加载包 导入数据 预处理数据(处理成实验要求的输入格式) 实验分析 将实验结果可视...
本文记录了:在生存分析中如何通过survminer包进行最佳阈值分组。 1. 查看示例数据“myeloma” 2. 最佳阈值分组 对变量【DEPDC1】进行最佳阈值分组(可同...
本文记录了:R包的安装路径默认在C盘,如何更改【R包的默认安装路径】,更改后如何恢复默认。 1. 先查看当前的R包的安装路径 2. 开始更改R包的安装路径 输入以下代码,打开...
浏览器直接搜索【R】 我的电脑是【window】,所以我下载这个 下载后安装只需要一直点确定就可以,如果要改安装路径的话,记得改下再点确定。
本文记录了:ggplot作图如何设置x轴、y轴标签与x轴、y轴的距离;用于增大x轴、y轴标签与x轴、y轴的距离。 0. 加载【ggplot2】包 1. 示例数据 2. 默认作...
本文记录了:ggplot作图如何加粗边框的问题;修改这些参数除了加粗边框,还可以有更多的效果。 0. 加载【ggplot2】包 1. 示例数据 2. 默认作图 3. 加粗边框...
本文记录了:我提交PBS作业的脚本模板;PBS常用的一些命令。 我提交PBS作业的脚本 上面这段代码的意思是:切换到【工作路径】后,选择指定版本的R,执行R语言脚本test....
本文记录了:vi/vim的快捷键,用途是方便查阅;我认为最常用的:i,Esc,:wq,q!,q,↑ ← ↓ →。 命令模式 模式命令描述命令模式i在当前光标位置进入输入模式命...
获取工作路径(注:切换也是用这个) 列出工作路径下所有文件 重命名文件
本文记录了t检验的3种类型及其应用条件,并就“适用情况、检验目的、应用条件”进行对比;“t检验的应用条件不满足时,如何比较两样本”。 t检验基本思想:通过计算两个样本的均值差...
writexl包功能比较简单,仅有输出 Excel 功能。优势:快速,不依赖java和Excel ,并且输出文件相比openxlsx包较小。注意:writexl包不会保存行名...
TCGA数据下载方法:gdc-client,Xena和gdcRNAtools 需要下载的数据组学信息(样本):(存储单个病人表达数据,需整理为表达矩阵) + (存储样本文件的...
下载界面直达:https://portal.gdc.cancer.gov/analysis_page?app=Downloads[https://portal.gdc.can...
1. 查看R的版本 2. 查看R包的版本 3. 列出当前工作路径下的所有文件 常见参数:path: 指定要列出文件的目录路径,默认为当前工作路径。pattern: 可选参数,...