小明的数据分析笔记本

一组对照加处理这种实验的差异表达分析结果通常是用火山图来展示，如果是很多组实验的话如何展示，这种情况我之前还没有遇到过。公众号后台有读者留言问到了如下的图 这个图来自于论文A...

小明的数据分析笔记本

做完转录组差异表达或者其他的一些分析拿到一些基因名称之后下一步通常是做一些注释，比如GO或者KEGG的注释，注释好以后通常是富集分析。如果是研究比较多的物种，可以直接使用R语...

亚里亚的塔

学习利用prcomp()进行PCA（主成分分析）利用base graghics和ggplot2来绘制PCA图确定每个成分的描述的差异找到影响最大的变量 建立模拟数据集 首先建...

小贝学生信

R-ggplot2-箱图系列（1） basic - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/bafbd08b28ef]R-ggp...

生信摆渡

https://r-pkgs.org/index.html[https://r-pkgs.org/index.html] 准备 安装 Rtools[http://cran.r...

Y大宽

Step by step 3鉴定一系列感兴趣的基因。 典型的是，这些基因是对你的实验调节反应比较强烈的基因（也就是差异基因）。下面讲描述三种和这些基因相关的输入网络数据到cy...

生信石头

写在前面 类似的主题，我们已经推出了一篇主题为《一键完成共线性（MCScanX）分析》的文章。推出之后一部分人用着挺好。也有相当部分朋友却不知为何遇到各种各样的问题。这些问题...

凯凯何_Boy

ggcor包最初是因为能快速实现19年Science一组合相关性图(上图所示)变得流行起来，除此该包对热图、热图等等的可视化都是很方便快捷的，除了之前介绍过的几种相关性图几种...