写在前面 热图,或称热力图,是外文 Heatmap 的直译。在几乎所有数值分析相关工作中都可以看到。生物信息学数据,自然躲不过。无论是形态数据,还是基因拷贝数数据,或是基因表...
1,人类所有基因蛋白序列下载 数据库地址:https://www.uniprot.org/tool-dashboard[https://www.uniprot.org/too...
@小小_4dbf 谢谢建议
安装R包 x86_64-conda_cos6-linux-gnu/bin/ld: cannot find -lxxx 问题解决问题 安装R包(ade4)时遇到以下问题(缺少库文件): 从报错信息可以看出报错根本原因是找不到lapack和blas库(-l 是lib的意思,xxx是库名) 问题解决: 1...
@小小_4dbf 谢谢补充
安装R包 x86_64-conda_cos6-linux-gnu/bin/ld: cannot find -lxxx 问题解决问题 安装R包(ade4)时遇到以下问题(缺少库文件): 从报错信息可以看出报错根本原因是找不到lapack和blas库(-l 是lib的意思,xxx是库名) 问题解决: 1...
@jerry_2018 已发,查收
maftools画棒棒糖图 (Lollipop chart)-基因突变可视化maftools是一个很强大的R语言可视化包,上篇“maftools画瀑布图(oncoplot)”(https://www.jianshu.com/p/6cccf7c4bb0...
1,散点图 结果示例: 输入文件示例: 代码: 2,散点图+拟合曲线+折线图 结果示例: 输入文件示例: 代码: 3,散点图+拟合曲线+部分点标注 结果示例: 输入文件示例:...
表示p值显著性。NS:表示不显著(P>0.05);*表示P<=0.05;**表示P<=0.01;***表示P<=0.001;****表示P<=0.0001
配对数据wilcox.test检验及可视化用途 配对样本秩和检验及可视化(箱线图) 代码 加载包 第一组数据检验及画图(不单独生成图片) 第2/3/4/5/6组数据检验及画图 把多个图片组合到一起 方法1: 方法2:...
定义 Pearson's chi squared test: Pearson卡方检验,由著名统计学家Karl Pearson提出,主要是比较两个及两个以上样本构成比以及两个分...
为什么要进行数据过滤 二代测序的下机数据经碱基识别得到的原始序列称为raw-data。raw-data中可能含有接头(adapter)、低质量序列及N序列(N 表示无法确定碱...
tags: Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要,去除一些无用的序列也可以提高后续分析的准确率和效率。Trimmomatic 是...
问题 安装R包(seqinr)时遇到以下问题(缺少config文件): 从报错信息可以看出报错根本原因是找不到zlib.h 问题解决: 1,确认是否安装zlib 注:上述命令...
问题 安装R包(ade4)时遇到以下问题(缺少库文件): 从报错信息可以看出报错根本原因是找不到lapack和blas库(-l 是lib的意思,xxx是库名) 问题解决: 1...
@熊歪歪 已发,查收。
maftools画棒棒糖图 (Lollipop chart)-基因突变可视化maftools是一个很强大的R语言可视化包,上篇“maftools画瀑布图(oncoplot)”(https://www.jianshu.com/p/6cccf7c4bb0...
PON构建方法一:vcftools PON构建方法二:GATK
产生原因 anaconda下安装的R,R目录下的/安装目录/bin/software/anaconda/lib/R/etc/Makeconf为空 解决版本 1,确定R安装路径...