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发简信
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5.1.1 edgeR
样本无重复与DESeq2的对比如下参考文章： https://www.jianshu.com/p/517167c50a5f[https://www.jianshu.com/p...
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miRNA Realtime引物设计（茎环法）
成熟miRNA长度在20bp左右，realtime合适的检测长度在80~150bp，因此需要在原有序列中增加茎环结构，以延长miRNA. 实验步骤：提取总RNA，反转录成cD...
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4.0 编码能力鉴定参考文章： http://rna-cpat.sourceforge.net/[http://rna-cpat.sourceforge.net/]http://blog.bio...
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3.0 转录本比对组装HISAT2+StringTie+cuffcompareHISAT2 下载参考基因组：Sbicolor_454_v3.0.1.fa sbi301（Phytozome） StringTie 参考文章： https://www.bio...
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你好，在GSEA富集分析那里，id后面有小数是因为使用了转录本的表达矩阵进行DESeq分析，我认为直接取整数是不合适的，应该使用基因count矩阵，重新计算logFC
R包clusterProfiler: 转换ID、GO/KEGG富集分析
参考这篇ID转换不用怕，clusterProfiler帮你忙这篇详细讲了无参考基因组该怎么办，值得一看 简单介绍一下几种常用的ID：Ensemble id：一般以ENSG开头...
