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    GEO数据库视频学习笔记(芯片数据下载和数据读取)

    之前写的的CHIP-seq和RNA-seq很多练习的数据都是从GEO数据库下载的。但是从来没有细致的了解过GEO这个数据库。趁着还没复工,再多学一点新知识~这次的笔记是生信技...

  • >modType=c(rep("Control",3),rep("DN",3))

    #构建分组模型,根据GSE1009样本的排列,前3个为正常样本,后3个为糖肾样本,构建一个分组的向量模型。

    >design <- model.matrix(~0+factor(modType))

    >colnames(design) <- c("Control","DN") 是不是这里要怎么特殊处理

    13.GEO数据集的R语言差异分析和代码解析--2.差异分析

    一、举例回顾 本节下载GSE1009数据集,使用limma包进行差异分析举例。 GSE1009 样本量:共6个样本,其中后3个为糖尿病肾病(DN)肾小球样本,前3个为正常肾小...

  • 你好,请教下我的数据集有对照组和另外两组不同的病人,想选对照和其中一种病人做,按照你的代码,到贝叶斯那一步报错,能帮忙看看怎么改吗?菜鸟一个

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