本节概览：1.STRING数据库基本介绍2.STRING R语言版——STRINGdb的使用：①STRINGdb数据库导入 ②获取STRING_id ③PPI绘制④clust...
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RNA-seq入门实战（九）：PPI蛋白互作网络构建（上）——STRING数据库的使用 -
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水稻GO和KEGG分析首先，一般我们分析水稻的数据时候，选用的是MSU和RAPDB这两个数据库的genome和gtf文件，这里只介绍MSU的ID，RAPDB的同理。 水稻GO分析的网站很多（这里不...
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m6A-seq_analysis_workflowgithub：https://github.com/scottzijiezhang/m6A-seq_analysis_workflow 网页：https://scottzij...
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PART2 m6A/MeRIP-seq
本次使用的是自己测序所得的cleandata 1.数据去除接头 2.去除adaptor以后进行数据质控 3.使用bowtie 比对 4.选用sambamba对来去重复 5.s...
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PART2 6mA-seq
1.比对 用bowtie 比对 选用sambamba对来去重复 smarttool对比对结果排序提取可靠的结果 指定目录下输出一下文件： 2.macs2 calling pe...
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WGCNA分析，简单全面的最新教程本文应该是第二全的WGCNA分析教程，参考了最新的文档。第一全的还在路上，会出现于生信宝典和宏基因组公众号组织的二代三代转录组测序分析实战班上，欢迎点击链接了解更多。 WGC...
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发散条形图/柱形偏差图该图来源于文章：Phenotype molding of stromal cells in the lung tumor microenvironment | Nature ...
