问题解决了，在每个megahit之后的文件序列名称中加上样本的名称，确保没有重复的序列名称就行了
求助：megahit拼装会出现重复的contig按照megahit+prodigal+cd-hit+salmon的流程，在进行salmon的时候会出现报错[puff::index::jointLog] [error] In...
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IP属地：青海
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试过后面的方法了，没用还是会出现同样的问题
求助：megahit拼装会出现重复的contig
按照megahit+prodigal+cd-hit+salmon的流程，在进行salmon的时候会出现报错[puff::index::jointLog] [error] In...
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求助：megahit拼装会出现重复的contig
按照megahit+prodigal+cd-hit+salmon的流程，在进行salmon的时候会出现报错[puff::index::jointLog] [error] In...
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我再试试用/1,/2能不能行
宏基因组分析（一）kneaddata质控及代码分享
病情说明： 虽然我是单细胞师兄，但是也做过宏基因组、代谢组和单细胞转录组的联合分析。文末会提供kneaddata的代码，联系我可以获得docker镜像和分析数据哦！！在此，我...
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谢谢师兄，我把他们的命名完全改成一样的了，反而还能计算出来😂
宏基因组分析（一）kneaddata质控及代码分享
病情说明： 虽然我是单细胞师兄，但是也做过宏基因组、代谢组和单细胞转录组的联合分析。文末会提供kneaddata的代码，联系我可以获得docker镜像和分析数据哦！！在此，我...
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师兄师兄，求助一个问题，我每行的标签也是唯一的，比如说我_1.fa 的文件标签是这样的@LH00190:229:22CY3CLT3:8:1101:1740:1032 1:N:0:AGGCGAAT+GAGGACGC，_2.fq的文件标签是这样的@LH00190:229:22CY3CLT3:8:1101:5401:1032 2:N:0:AGGCGAAT+GAGGACGC，但是我kneaddata出来之后paired的结果还是0，全部的结果在bowtie2_unmatched文件中。后来我给每一行标签的末尾加上了\1,\2去区分，但是最终结果也还是零。这是什么原因啊😭
宏基因组分析（一）kneaddata质控及代码分享
病情说明： 虽然我是单细胞师兄，但是也做过宏基因组、代谢组和单细胞转录组的联合分析。文末会提供kneaddata的代码，联系我可以获得docker镜像和分析数据哦！！在此，我...
