香农熵（Shannon Entropy）最初是信息论中衡量信息不确定性的一个数学工具。在分子进化和基因组演化领域，它提供了一个独特的视角，将基因组视为承载信息的“信使”，把演...
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香农熵与分子进化2026-08-18
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西湖大学分子演化方向2026-08-18
郑甲博士生命科学学院https://www.westlake.edu.cn/faculty/jia-zheng.html[https://www.westlake.edu.c...
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指标陷阱 2026-01-28
“代理指标陷阱”是指：当一个指标被用来替代（代理）一个难以量化的真实目标后，人们开始过度优化这个代理指标本身，反而损害了真正的目标。 换句话说，原本是为了“指路”，最后却变成...
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氨基酸序列重编码2026-01-28我认为重编码不仅仅在于消除数据异质性问题，更是删减信息的过程中将数据保守化，将噪声信息屏蔽了，因此适合更古老关系的推断 对氨基酸序列重编码使用下列命令可以自由选择不同编码表 ...
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文献阅读2026-01-26Deep evolutionary conservation of a sex-determining locus without sequence homology htt...
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文献阅读2026-01-19Dated gene duplications elucidate the evolutionary assembly of eukaryotes https://www.n...
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选刊工具2026-01-12Journal Suggester Springer Nature出版商推出的选刊系统https://journalsuggester.com/[https://journa...
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文献阅读2026-01-12Integrative phylogenomics positions sponges at the root of the animal tree https://www....
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文献阅读20260105Stage-specific master genes in holometabolous development and their advances in Spodopt...
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HiC-Pro安装记录2025-11-10https://github.com/nservant/HiC-Pro[https://github.com/nservant/HiC-Pro] 官方提供方式根本不行，yml...
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AB下载管理器 办公生态2025-11-05官网 我只一直非常嫌弃迅雷下载，乱七八糟链接太多了，广告也很烦。 而IDM别怪我说什么，审美至少停留在了20年前吧？ 而浏览器自带的下载也还行，但是不是什么链接都可以下载，而...
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文献阅读2025-10-20Multiple bursts of speciation in Madagascar’s endangered lemurs https://www.nature.com/...
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前言和讨论2025-09-15
前言要回答三个问题 研究背景与领域是什么？要回答的问题： 你的研究处于一个怎样的大背景下？这个研究领域目前总体情况如何？将读者从广袤的知识领域引导至一个具体的范围。 已有研究...
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基因组进化2025-09-15The origin and maintenance of supergenes contributing to ecological adaptation in Atlan...
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谱系速率多样化BAMM 分析 2025-03-29RevBayes[https://revbayes.github.io/tutorials/divrate/ebd.html]需要进一步的研究 使用BAMM估算分化速率[ht...
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文献阅读2025-09-08A diverse and distinct microbiome inside living trees[https://www.nature.com/articles/s...
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关于好奇的问题 2025-09-01
《Science》125周年纪念特刊上发表的文章《125》[https://www.science.org/doi/10.1126/science.1115951]中这样说：...