发简信
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Perl语言是生信学习的基础需要。
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生信相关的perl知识收集
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@王雪琴_e546 分开做
系统发育比较分析—R
系统发育树是研究物种进化历史必不可少的信息，我们可以利用它得到一些重要历史线索，如： 生物多样性（物种形成或灭绝）； 物种性状进化与多样化（Character evoluti...
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「基因组」基因共线性可视化（待更新）软件 1.JCVI2.NGenomeSyn3.synvisio在线工具：链接 https://synvisio.github.io/[https://synvisio.git...
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genblastg和genewise鉴定缺失基因
基于组装好的基因组，例如某一个基因在该基因组中无注释，需检查是否为注释错误，还是该基因本身缺失。 软件：genblastg和genewise genblastg下载地址：ht...
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接上，pcoc检测氨基酸性质的趋同
pcoc检测 step1. 处理树文件；将第2步生成的02_Trees文件夹拷贝到当前目录，并修改为.txt结尾 step2：处理序列文件 step3: 准备需要检测物种的文...
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仅作个人笔记 - 基于fithic的输出结果统计染色体体间显著互作的密度0.仅作个人笔记使用意思就是只考虑我能不能看懂 fithic的安装、使用这里略去假定已经运行完了fithic 输入文件长这样: 输出文件: 最后画一个核型图 核型图的绘制参考...
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WGDI - 推断祖先核型0.仅作个人笔记使用意思就是只考虑我能不能看懂具体每个参数的含义参照官方文档, 这里全部用默认参数https://wgdi.readthedocs.io/en/latest/...
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ChromoSSE: 染色体数目进化/Chromosome Number Evolutionhttps://github.com/wf8/ChromoSSE[https://github.com/wf8/ChromoSSE] 1.输入文件的准备.两个文件, 一个是进...
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2023-09-21 PSMC可以评估有效群体大小的原因
介绍这个软件的概念前，我需要先解释一个概念最近共同祖先时间（the time since the most recent common ancestor，TMRCA）。当我们...
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随笔 | 十年之后，我们仍然没能坐在一起喝上一口啤酒时间过得很快，或许可以说，从7月底到现在，我仍然没有忙完手头的事情。上午收到消息时，我仍然在赶着项目，有时候，不知道是对是错。多算一年半年，与基友「酱油」认识可能也是10年。...
