ATAC-seq分析 所用到的软件和ChIP-seq一样,所以直接在ChIP环境下进行即可 MD5值校验 用trim-galore软件质控过滤,然后直接fastqc 输入以下...
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ChIP-seq分析 创建小环境 安装软件 数据下载 数据转换,sra格式转换为fastq格式 |单个命令如下 过滤,用trim-galore软件,直接fastqc 因为文件...
我的不行哎
Xshell6和Xftp6 破解免安装版,无窗口多开限制上班第一天发现xshell6评估已过期,网上搜索破解版基本都是免费版的破解,有窗口多开限制,而且安装包相对较大,费了1个小时才找到一个免安装绿色破解版的xshell6和xft...
一.安装miniconda/annaconda 1.下载 2.安装 3.确认安装成功 调出帮助文档 4.配置镜像(安装一次配置一次即可) 二、创建小环境 创建 conda c...
环境变量 在某一环境的变量,比如登录时的当前环境。投递任务时的环境变量以及赋值的变量等。能在环境中取到的变量内容!可以清空、赋值变量避免赋值PATH,避免大小写乱用 目录 根...
Markdown 语法 typora文档 见pdf文件 插入标题:### 加空格 加文字插入代码块:Rimage.pngimage.png插入引言 > l...
array与循环 array 数组是矩阵的集合array(data = NA, dim = length(data), dimnames = NULL)维度:二维或以上...
step_1 创建向量 函数c() 、 sep() 、 rep() 、 paste() 、 paste0() step_2 索引 可以用位置、名字、逻辑值进行索引 step_...
内容 • 循环-数组|数据框• 循环-因子• 循环-while| if else• 数据处理-排序|集合|长宽• 字符操作及其他 心得: 听晓娟老师的课程,总有一种豁然开朗的...
关于limma包差异分析结果的logFC解释 http://www.bio-info-trainee.com/1209.html 首先,我们要明白,limma接受的输入参数就...
首先在NCBI里找到该文章的GSE编号:GSE5282 step_1 数据下载 提取表达矩阵 提取临床信息,用pData函数 step_2 获得分组信息 step_3 主成分...
一、统计学相关知识 首推参考推文:https://mp.weixin.qq.com/s/OtB2h6f00U2SRZLzveJKfQ 数据整理的一般描述 1、关于百分位数的理...
统计学基本概念 四分位数(Quartile) 统计学中,把所有数值由小到大排列并分成四等份,处于三个分割点位置的数值就是四分位数。第一,四分位数 (Q1),又称“较小四分位数...
GEOquery包使用说明书 https://www.jianshu.com/p/0d32fd410bcf 作业6 问题 pheatmap::pheatmap(dat,sca...
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作业3 找到R包CLL内置的数据集的表达矩阵里面的TP53基因的表达量,并且绘制在 progres.-stable分组的boxplot图答案如下: ID转换:在ids文件中,...
时间:2019.7.4内容:初级题与中级题 分组 频数图 使用ggplot2画图 箱图 频数图 密度图 使用ggpubr作图 箱图 频数图 密度图 随机取384个MBases...